Модуль python для анализа CGH

Question

Я ищу модуль в python для анализа CGH для биоинформатики. Я нахожу некоторые инструменты, но они основаны на Интернете, и я не нашел ни одного модуля в python, который занимается анализом CGH также со всеми графиками.
Мне нужен модуль командной строки в python.

Пожалуйста, дайте мне знать Если кто-то знает о том же.

спасибо

Answer 1

Я сомневаюсь, что вы найдете его. Если вы работаете с массивом, и хотите его запустить через командную строку, узнайте R и заберите один из множества пакетов для анализа CGH. Я уверен, что есть некоторые привязки python/R, чтобы помочь вам.

http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/CGHcall.html

http://www.bioconductor.org/packages/2.11/bioc/html/CGHnormaliter.html

http://www.hindawi.com/journals/cfg/2009/201325/