google-genomics

1зной

1ответ

Можно ли использовать модуль обнаружения из Google apiclient в Cloud Datalab?

У меня есть простой скрипт, питона, который делает что-то вроде этого: from apiclient import discovery from oauth2client.client import GoogleCredentials ggSvc = discovery.build ('genomics', 'v1', cr

0зной

1ответ

Определение параллельной среды на Google Compute Engine с использованием Elasticluster

Недавно я создал кластер Grid Engine на вычислительном двигателе с использованием Elasticluster (http://googlegenomics.readthedocs.org/en/latest/use_cases/setup_gridengine_cluster_on_compute_engine/in

0зной

1ответ

Сколько Google-геномики открыты для тех, кто изучает другие организмы?

Мне интересно, насколько большая часть среды Google Genomics достаточно гибкая для тех, кто не работает на человеческом геноме? Я не мог найти очевидного места, чтобы ответить на этот вопрос, и предпо

0зной

2ответ

Есть ли у dockstore-tool-samtools-index GATK/BAM/Chromwell уже настроенный?

Просто хотел узнать, есть ли изображение докера с именем dockstore-tool-samtools-index, которое доступно здесь «https://quay.io/repository/cancercollaboratory/dockstore-tool-samtools-index» и предоста

1зной

2ответ

Google Genomics работа никогда не заканчивающаяся

Мы использовали Google Genomics ReadGroupSets для хранения наших данных выравнивания (BAM-файлы) и он работает удивительно, что до вчерашнего дня ... Вчера (08/29/2016) наших импортных вакансий (Метод

0зной

1ответ

Как преобразовать столбцы в строку в Terminal Linux? Но более сложный

Как преобразовать столбцы в строку в Terminal Linux? Но более сложная ... Ниже приведен пример моих данных: SNP_Name ID_Animal Allele Chr Position rs01 215 AB 1 100 rs02 215 AA 2

2зной

3ответ

Местоположение Google Cloud/BigQuery/Genomics

Для работы нашей компании требуется, чтобы данные в Облаке хранились в США. Для Google Cloud я могу указать местоположения ковша в США. https://cloud.google.com/storage/docs/bucket-locations Но для Bi

1зной

3ответ

Как сжать список файлов в один файл gzip с использованием инструментов для эластичных, сетчатых двигателей и облака Google

Я хочу начать с того, что поблагодарить вас за вашу помощь заблаговременно, поскольку это поможет прояснить детали оставлен на the readthedocs.io guide. Мне нужно сжать несколько файлов в один gzip, о

0зной

2ответ

Почему экземпляры Google Pipeline VM висят бесконечно?

Я использую Dockerflow для выполнения параллельных задач с помощью API-интерфейсов Google для Google Cloud Platform. Я начал одношаговую задачу, запускающую 1389 виртуальных машин параллельно, и обнар