biojava

3зной

2ответ

Java Bioinformatics - получить все индексы нескольких конкретных слов в строке

У меня есть проект на моем курсе Bioinformatics в университете, и одна из вещей в моем проекте - предсказание генов. Моя проблема сегодня в том, как получить все индексы более чем одного конкретного с

java bioinformatics biojava 2015-05-17

---

1зной

1ответ

Как использовать формат mmCIF вместо PDB в BioJava?

У меня есть небольшая проблема ... Я знаю, что для скачивания структуры PDB с помощью BioJava я должен использовать Structure s = StructureIO.getStructure("code"); Что я должен сделать, чтобы исполь

java protein-database biojava 2016-06-22

---

1зной

1ответ

Biojava: HET Аминокислоты

Чтение PDB структуры 2А65 я столкнулся случай аминокислотного остатка, который следует рассматривать как «лиганд белка», а не «части белка». В файле PDB, а также в cif-файлах этот остаток LEU.601 поме

biojava 2016-03-21

---

0зной

1ответ

java.net.SocketException: Сеть недоступна (Eclipse в Windows 8)

У меня возникают проблемы с запуском моего кода с помощью Eclipse в Windows 8. Ниже приведенный ниже код работает в Eclipse в Linux, но не в Windows 8. package first import org.biojava.bio.struc

java eclipse scala biojava 2014-01-20

---

-2зной

1ответ

Объединить два больших текстовых файла при сравнении чисел

Я хочу сделать большой текстовый файл из данных в двух больших текстовых файлах (около 2 или 3 Гб), используя Java. Я должен объединить эти два файла в один, при сравнении чисел в этих текстовом файле

java sequence bioinformatics fasta biojava 2015-09-09

---

0зной

1ответ

Biojava sample run с ExceptionInInitializerError

Я попытался запустить очень простой образец BioJava копия & pase из wikipedia. package test; import org.biojava.nbio.data.sequence.FastaSequence; import org.biojava.nbio.ronn.Jronn; public cl

java jvm bioinformatics biojava 2015-10-31

---

1зной

2ответ

Невозможно получить биояву для работы в приложении Maven Netbeans

У меня проблема с BioJava для работы в приложении RCP NetBeans, построенном с использованием Maven. Я создал модуль Maven в качестве обертки, включая пакеты org.biojava. * И org.forester. * Как общедо

java maven netbeans netbeans-platform biojava 2015-11-02

---

0зной

1ответ

Как пронумеровать базовые метки на хроматограмме?

Я создал изображение хроматограммы (последовательности dna). Как я могу поместить число над каждой базой? Я могу получить длину пикселя изображения и количество оснований. Если бы я разделил их, я бы

java swing biojava 2016-02-14

---

0зной

1ответ

Как интегрировать значения достоверности в изображения хроматограммы ДНК?

Я использую biojava для создания хроматограммы. Хроматограмма - это изображение. Каждая базовая ячейка удерживается в пределах прямоугольника. Чтобы получить координату x (слева): gfx.getCallboxBounds

java swing graphics2d biojava 2016-02-15

---

0зной

1ответ

ошибка импорта пакета biojava

Я загрузил файлы java java java и сохранил в своем классе путь. Я пытаюсь пример для тестирования от: http://www.biojava.org/wiki/BioJava:CookBook:Core:FastaReadWrite , но он дает мне ошибку: error: p

java bioinformatics biojava 2013-11-02

---