Установка пакета R: использование локально установленных библиотек

Question

В частности, я пытаюсь установить rggobi локально на linux (у меня нет доступа root). Поэтому я установил ggobi local

cd ggobi-2.1.11/ 
./configure --prefix=~/my-apps/ --with-all-plugins 
make 
make install 

Все прошло нормально. Тогда я попытался

$ R CMD INSTALL /tmp/Rtmp2PL6au/downloaded_packages/rggobi_2.1.20.tar.gz -l ~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/ 
* installing *source* package ‘rggobi’ ... 
** package ‘rggobi’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config 
checking pkg-config is at least version 0.9.0... yes 
checking for GGOBI... no 
configure: error: Package requirements (ggobi >= 2.1.6) were not met: 
No package 'ggobi' found 

Consider adjusting the PKG_CONFIG_PATH environment variable if you installed software in a non-standard prefix. 
Alternatively, you may set the environment variables GGOBI_CFLAGS and GGOBI_LIBS to avoid the need to call pkg-config. 
See the pkg-config man page for more details. 
ERROR: configuration failed for package ‘rggobi’ 
* removing ‘/apps/infrafs1/rdahiya/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/rggobi’ 

Я попытался добавления ~/мои-приложения/Библиотека/pkg-config/в PKG_CONFIG_PATH, который помог Installtion пойти немного дальше, но в конце он дает различные ошибки

building package indices 
testing if installed package can be loaded 
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
unable to load shared object '~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/rggobi/libs/rggobi.so': libggobi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory 
Error: loading failed 
Execution halted 
ERROR: loading failed 
removing ‘~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.1/rggobi’ 

libggobi.so .0 есть в ~/my-apps/lib /. Любое предложение, как сделать R, чтобы посмотреть на правильное место?

Answer 1

Я нашел (?) Работу вокруг. Я должен установить LD_LIBRARY_PATH = ~/my-apps/lib/во время установки или во время любой будущей сессии R, где я хочу загрузить rggobi. Пожалуйста, поделитесь, если у вас есть более чистое решение.