Удалить строку из текстового файла

Question

У меня есть очень большой текстовый файл, состоящий из 10000S линий, например, так:

 
Contig9 Pfam protein_match 57 81 1.9E-6 + . Name=PF12874;Note=Zinc-finger of C2H2 type;Target=null 57 81;status=T;ID=match$554_57_81;date=10-10-2014 
Contig9 SMART protein_match 54 88 9.4E-9 + . Name=SM00451;Note=U1-like zinc finger;Target=null 54 88;status=T;ID=match$555_54_88;Ontology_term="GO:0003676" 

Я хотел бы, чтобы удалить часть с ;ID=matchXXXXX из всех линий.

Будет ли простой способ сделать это с помощью VIM awk или sed в unix?

Answer 1

Вы можете попробовать так:

awk '{sub(";ID=match[^;]+","")}1' input_file 

Надеюсь, это поможет!

Answer 2

Вы можете использовать :%s команду:

:%s/ID=match.\{-};//g 

Это удаляет все вхождения ID=match следуют любые символы (\{-}, чтобы сделать его не жадный), а затем ; ни с чем (извлекая его).

После выполнения вы получите

Contig9 SMART protein_match 54 88 9.4E-9 + . Name=SM00451;Note=U1-like zinc finger;Target=null 54 88;status=T;Ontology_term="GO:0003676" 

вместо

Contig9 SMART protein_match 54 88 9.4E-9 + . Name=SM00451;Note=U1-like zinc finger;Target=null 54 88;status=T;ID=match$555_54_88;Ontology_term="GO:0003676" 

Обратите внимание на ID=match$555_54_88; был удален

Answer 3

sed -i 's/ID=match.*;//' file.txt