2016-08-31 2 views
1

Я компилирую код на C++ вместе с подпрограммой Fortran. C++ CPP код как:Смешанное программирование на языке C++/Fortran: неопределенная ссылка на `_gfortran_reshape_r8 '

#include "Calculate.h" 
extern "C" double SolveEq_(double *Gvalue, double *GvalueU, double *GvalueV, double *Gnodex, double *Gnodey, double *GtimeInc, double *Glfs); 

template <class T1, class T2> 
void Calculate(vector<Element<T1, T2> > &elm, GParameter &GeqPm, GmeshInfo &Gmesh) 
{ 
    // Solving Equation using Fortran code 
    SolveEq_(&Gmesh.Gvalue[0], &Gmesh.GvalueU[0], &Gmesh.GvalueV[0], &Gmesh.Gnodex[0], &Gmesh.Gnodey[0], &GeqPm.GtimeInc, &GeqPm.Glfs); 
    return; 
} 

И Fortran код, как:

!========================================================================== 
Module Inputpar 
Implicit None 
Integer,parameter :: Numx = 200, Numy = 200 
End Module 
!======================================== PROGRAM ============================================= 
Subroutine SolveEq(Gvalue, GvalueU, GvalueV, Gnodex, Gnodey, Deltat, Lfs); 
Use Inputpar 
Implicit None 

Real*8 Deltat, Lfs, Dt, Su 
Real*8 Gvalue(1, (Numx+1)*(Numy+1)), GvalueU(1, (Numx+1)*(Numy+1)), GvalueV(1, (Numx+1)*(Numy+1)) 
Real*8 Gnodex(0:Numx), Gnodey(0:Numy) 

Real*8 DX, DY 
Real*8 X(-3:Numx+3), Y(-3:Numy+3) 
Real*8 VelX(-3:Numx+3,-3:Numy+3), VelY(-3:Numx+3,-3:Numy+3) 
Real*8 G(-3:Numx+3,-3:Numy+3) 

Common /CommonData/ X, Y, DX, DY, VelX, VelY, G, Dt, Su 

!============================= Data Transfer ============================ 
Dt     = Deltat 
Su     = Lfs 
X   (0:Numx) = Gnodex(0:Numx) 
Y   (0:Numy) = Gnodey(0:Numy) 
VelX(0:Numx,0:Numy) = transpose(reshape(GvalueU,(/Numy+1,Numx+1/))) 
VelY(0:Numx,0:Numy) = transpose(reshape(GvalueV,(/Numy+1,Numx+1/))) 
G (0:Numx,0:Numy) = transpose(reshape(Gvalue ,(/Numy+1,Numx+1/))) 

!==========Some other lines neglected here================= 

End 
!======================================== END PROGRAM ========================================= 

Во-первых компиляции Fortran кода с помощью команды:

 gfortran SolveEq.f90 -c -o SolveEq.o 

А затем скомпилировать C++/Fortran коды вместе с использованием файла makefile:

# Compiler 
CC = g++ 

# Debug option 
DEBUG = false 

# Source directory of codes 
SRC1 = /home 
SRC2 = $(SRC1)/Resources 
SRC3 = $(SRC1)/Resources/Classes 

OPT=-fopenmp -O2 

ifdef $(DEBUG) 
    PROG=test.out 
else 
    PROG=i.out 
endif 

# Linker 
#LNK=-I$(MPI)/include -L$(MPI)/lib -lmpich -lopa -lmpl -lpthread 

OBJS = libtseutil.a Calculate.o SolveEq.o 

OBJS_F=$(OBJS) 
SUF_OPTS1=$(OBJS_F) 
SUF_OPTS2=-I$(SRC2)/ 
SUF_OPTS3=-I$(SRC3)/ 
SUF_OPTS4= 

# Details of compiling 
$(PROG): $(OBJS_F) 
    $(CC) $(OPT) -o [email protected] $(SUF_OPTS1) 
%.o: $(SRC1)/%.cpp 
    $(CC) $(OPT) -c $< $(SUF_OPTS2) 
%.o: $(SRC2)/%.cpp 
    $(CC) $(OPT) -c $< $(SUF_OPTS3) 
%.o: $(SRC3)/%.cpp 
    $(CC) $(OPT) -c $< $(SUF_OPTS4) 

# Clean 
.PHONY: clean 
clean: 
    @rm -rf *.o *.oo *.log 

Однако ошибка показывает, что:

g++ -fopenmp -O2 -o libtseutil.a Calculate.o SolveEq.o 
Calculate.o: In function `void Calculate<CE_Tri, SolElm2d>(std::vector<Element<CE_Tri, SolElm2d>, std::allocator<Element<CE_Tri, SolElm2d> > >&, GParameter&, GmeshInfo&)': 
Calculate.cpp:(.text._Z10CalculateGI6CE_Tri8SolElm2dEvRSt6vectorI7ElementIT_T0_ESaIS6_EER10GParameterR9GmeshInfo[_Z10CalculateGI6CE_Tri8SolElm2dEvRSt6vectorI7ElementIT_T0_ESaIS6_EER10GParameterR9GmeshInfo]+0x3c): undefined reference to `SolveEq_' 
SolveEq.o: In function `solveeq_': 
SolveEq.f90:(.text+0x2b8e): undefined reference to `_gfortran_reshape_r8' 
SolveEq.f90:(.text+0x2d2a): undefined reference to `_gfortran_reshape_r8' 
SolveEq.f90:(.text+0x2ec6): undefined reference to `_gfortran_reshape_r8' 
SolveEq.f90:(.text+0x31fa): undefined reference to `_gfortran_reshape_r8' 
collect2: error: ld returned 1 exit status 

Как же это происходит?

Я использовал простой случай для проверки смешанного компиляции. Код C++ был:

#include <stdlib.h> 
#include <stdio.h> 
#include <iostream> 
#include <vector> 
using namespace std; 

extern "C" double fortran_sum_(double *sum, double *su2m, double *vec, double* vec2, int *size); 

int main(int argc, char ** argv) 
{ 
    int size; 
    double sum, sum2; 
    double aa,bb,cc,dd; 
    vector<double> vec; 
    vector<double> vec2; 

    size=2; 
    aa=1.0; 
    bb=2.0; 
    sum=0.0; 
    sum2=0.0; 

    vec.push_back(aa); 
    vec.push_back(bb); 
    vec2.push_back(aa*2.0); 
    vec2.push_back(bb*2.0); 

    fortran_sum_(&sum, &sum2, &vec[0], &vec2[0], &size); 

    cout << "Calling a Fortran function" << endl; 
    cout << "============================" << endl; 
    cout << "size = " << size << endl; 
    cout << "sum = " << sum << endl; 
    cout << "sum2 = " << sum2 << endl << endl; 
} 

И Fortran код был:

Subroutine fortran_sum(gsum, gsum2, gvec, gvec2, gsize2) 
    integer gsize,gsize2 
    real*8 gvec(0:gsize2-1), gvec2(0:1) 
    real*8 gsum, gsum2 
    gsum = gvec(0)+gvec(1); 
    gsum2 = gvec2(0)+gvec2(1); 
    gsize = gsize*2; 
end 

Затем используемые команды для компиляции:

gfortran fortran_sum.f90 -c -o fortran_sum.o 
g++ fortran_sum.o call_fortran.cpp -o a.out 
./a.out 

Он работал хорошо:

Calling a Fortran function 
============================ 
size = 2 
sum = 3 
sum2 = 6 
+0

Я использовал простой случай для тестирования смешанного программирования, код C++: –

+1

Возможно, вам нужно установить связь с libgfortran? –

+0

@ZetianRen, у вас есть * nm * или * objdump * или любые такие инструменты в вашей коллекции компиляторов (или предоставлена ​​операционная система)? Вы можете посмотреть в файле fortran_sum.o, чтобы увидеть, есть ли SolveEq_ (или если у него есть другое имя варианта для него). – blackpen

ответ

1

функция _gfortran_reshape_r8 есть p искусство библиотеки, которое используется кодом, составленным gfortran. Когда вы компилируете на одном языке, такие библиотеки автоматически связаны, потому что любая программа, которую вы используете для связи, знает о них. Когда вы связываете смешанный код, вам нужно найти и явно ввести в командной строке библиотеки для языка, который не соответствует выбранному вами компоновщику. Обычно вы связываетесь с синтаксисом C++, как вы это делали, и явно добавляете библиотеки компилятора fortran.

+0

Спасибо. Вы имеете в виду, что я должен отредактировать мою линию Linker в make-файле? –

+0

Да, вам нужно будет найти библиотеку, содержащую библиотеки Fortran, и поместить ее в командную строку компоновщика с флагом '-L'. Вам также нужно будет включить отдельные библиотеки с соответствующими флагами '-l'. – Brick

+0

Из комментариев по вашему вопросу, похоже, что вам нужна определенная библиотека 'libgfortran', поэтому найдите ее и поместите в каталог с флагом' -L' (как это было сделано для других пакетов в вашем примере), а затем «-lgfortran». Вы можете обнаружить, что вам нужно больше библиотек, но 'gfortran' звучит правильно. (Я сделал это раньше, но не недавно.) – Brick

1

Я немного слаб на языке Fortran. Когда я скомпилировал ваш код fortran и пропустил его через nm, он дал мне следующее. Символ «SolveEq_» отсутствует. Существует только «solveeq_».

0000000000000020 r A.15.3480 
0000000000000000 r A.3.3436 
0000000000000010 r A.9.3463 
       U _gfortran_reshape_r8 
00000000000fbe28 C commondata_ 
       U free 
       U malloc 
0000000000000000 T solveeq_ 

Edit: Составлен для меня, когда я использовал "solveeq_". Вот упрощенный код демки (main.cpp):

extern "C" double solveeq_(
       double *Gvalue, double *GvalueU, 
       double *GvalueV, double *Gnodex, 
       double *Gnodey, double *GtimeInc, double *Glfs 
      ); 

template <typename T> 
void Calculate(T *one, T *two, T *three, 
       T *four, T *five, T *six, T *seven) { 
    solveeq_(one,two,three,four,five,six,seven); 
} 

int main(int argc, char ** argv) { 
    double one,two,three,four,five,six,seven; 
    Calculate<double>(&one,&two,&three,&four,&five,&six,&seven); 
} 

Составитель как (f.f90 имеет Фортран код):

gfortran -c f.f90 
g++ f.o main.cpp -lgfortran 

кажется, с 2003 года, если вы хотите вызвать функцию fortran из C/C++, вы можете использовать BIND (возможно, это не для fortran/fortran, но без каких-либо дополнительных усилий).

Subroutine SolveEq(F) BIND(C,NAME="SolveMyEquation") 
Real Gvalue, GvalueU, GvalueV, Gnodex, Gnodey, Deltat, Lfs 
End

+0

Спасибо! Я изменил имя функции на solveeq.f90, и все это было написано маленькими буквами, и оно прошло. –

+0

Фортран нечувствителен к случаю. В зависимости от компилятора все символы, как правило, преобразуются во все кепки или все ниже в сборке. Также в зависимости от компилятора и имени функции вы можете получить 0, 1 или два символа подчеркивания, добавленные к имени символа. Это необходимо учитывать при выполнении связей между языками, но я подчеркиваю, что он зависит от компилятора. – Brick

0

Благодаря каждому, особенно @Brick и @blackpen. Проблема устранена.

1), Добавить -lgfortran в командную строку, чтобы функция, в противном случае она покажет: неопределенная ссылка на `_gfortran_reshape_r8 '.

2), измените имя функции .f90 в маленькие буквы «solveeq» другой мудрый он будет показывать: неопределенная ссылка на `SolveGeq_»

Итак, наконец, мой .cpp превращается в:

#include "Calculate.h" 
extern "C" void solveeq_(double *Gvalue, double *GvalueU, double *GvalueV, double *Gnodex, double *Gnodey, double *GtimeInc, double *Glfs); 

template <class T1, class T2> 
void Calculate(vector<Element<T1, T2> > &elm, GParameter &GeqPm, GmeshInfo &Gmesh) 
{ 
    // Solving Equation using Fortran code 
    solveeq_(&Gmesh.Gvalue[0], &Gmesh.GvalueU[0], &Gmesh.GvalueV[0], &Gmesh.Gnodex[0], &Gmesh.Gnodey[0], &GeqPm.GtimeInc, &GeqPm.Glfs); 
    return; 
} 

Фортран код .f90, как:

!========================================================================== 
Module Inputpar 
Implicit None 
Integer,parameter :: Numx = 200, Numy = 200 
End Module 
!======================================== PROGRAM ============================================= 
Subroutine SolveEq(Gvalue, GvalueU, GvalueV, Gnodex, Gnodey, Deltat, Lfs); 
Use Inputpar 
Implicit None 

Real*8 Deltat, Lfs, Dt, Su 
Real*8 Gvalue(1, (Numx+1)*(Numy+1)), GvalueU(1, (Numx+1)*(Numy+1)), GvalueV(1, (Numx+1)*(Numy+1)) 
Real*8 Gnodex(0:Numx), Gnodey(0:Numy) 

Real*8 DX, DY 
Real*8 X(-3:Numx+3), Y(-3:Numy+3) 
Real*8 VelX(-3:Numx+3,-3:Numy+3), VelY(-3:Numx+3,-3:Numy+3) 
Real*8 G(-3:Numx+3,-3:Numy+3) 

Common /CommonData/ X, Y, DX, DY, VelX, VelY, G, Dt, Su 

!============================= Data Transfer ============================ 
Dt     = Deltat 
Su     = Lfs 
X   (0:Numx) = Gnodex(0:Numx) 
Y   (0:Numy) = Gnodey(0:Numy) 
VelX(0:Numx,0:Numy) = transpose(reshape(GvalueU,(/Numy+1,Numx+1/))) 
VelY(0:Numx,0:Numy) = transpose(reshape(GvalueV,(/Numy+1,Numx+1/))) 
G (0:Numx,0:Numy) = transpose(reshape(Gvalue ,(/Numy+1,Numx+1/))) 

!==========Some other lines neglected here================= 

End 
!======================================== END PROGRAM ========================================= 

И Makefile, как:

# Compiler 
CC = g++ 

# Debug option 
DEBUG = false 

# Source directory of codes 
SRC1 = /home 
SRC2 = $(SRC1)/Resources 
SRC3 = $(SRC1)/Resources/Classes 

OPT=-fopenmp -O2 

ifdef $(DEBUG) 
    PROG=test.out 
else 
    PROG=i.out 
endif 

# Linker 
#LNK=-I$(MPI)/include -L$(MPI)/lib -lmpich -lopa -lmpl -lpthread 

OBJS = libtseutil.a Calculate.o solveeq.o 

OBJS_F=$(OBJS) 
SUF_OPTS1=$(OBJS_F) 
SUF_OPTS2=-I$(SRC2)/ 
SUF_OPTS3=-I$(SRC3)/ 
SUF_OPTS4= 

# Details of compiling 
$(PROG): $(OBJS_F) 
    $(CC) $(OPT) -o [email protected] $(SUF_OPTS1) 
%.o: $(SRC1)/%.cpp 
    $(CC) $(OPT) -c $< $(SUF_OPTS2) 
%.o: $(SRC2)/%.cpp 
    $(CC) $(OPT) -c $< $(SUF_OPTS3) 
%.o: $(SRC3)/%.cpp 
    $(CC) $(OPT) -c $< $(SUF_OPTS4) 
solveeq.o: $(SRC1)/solveeq.f90 
    gfortran -c $< 

# Clean 
.PHONY: clean 
clean: 
    @rm -rf *.o *.oo *.log 
+0

См. Мой связанный комментарий о случае имен функций в ответе от @blackpen. – Brick

Смежные вопросы