2017-02-08 8 views
1

Следующий код crashed мой сеанс R. Я попробовал его в обоих RStudio и Конда R в Jupyter Notebook:функции из пакета tmap вылетают мои R

qtm(shp = countries_spdf, fill = "population") 
tm_shape(countries_spdf) + tm_fill(col = "population") 

Вы можете получить набор данных из кода ниже:

download.file("http://s3.amazonaws.com/assets.datacamp.com/production/course_1816/datasets/02_countries_spdf.rds","data/02_countries_spdf.rds") 
countries_spdf <- readr::read_rds("data/02_countries_spdf.rds") 

Ошибка:

Assertion failed: (0), function query, file AbstractSTRtree.cpp, line 285. Abort trap: 6

среды :

  • Mac OSX 10.10.5
  • R версия 3.3.1 (2016-06-21)
  • Конда 4.3.9
  • jupyter ноутбук 4.2.3
  • RStudio Версия 1.0.44
+0

К сожалению, я не могу воспроизвести авария. Вероятно, это вызвано одной из библиотек gdal или geos. Имеет ли библиотека (sp); plot (countries_spdf) работает? –

+0

@MartijnTennekes Да, это работает. –

ответ

0

Возможно, это не связано, но я даже не могу загрузить текущую версию tmap и tmaptools для загрузки. Когда я пытаюсь, он сбрасывает R.

> library(tmap) 

*** caught segfault *** 
address 0x18, cause 'memory not mapped' 

Traceback: 
1: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) 
2: library.dynam(lib, package, package.lib) 
3: loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) 
4: asNamespace(ns) 
5: namespaceImportFrom(ns, loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc,  .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]), i[[2L]], from = package) 
6: loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) 
7: asNamespace(ns) 
8: namespaceImportFrom(ns, loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc,  .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]), i[[2L]], from = package) 
9: loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) 
10: namespaceImport(ns, loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()),  versionCheck = vI[[i]]), from = package) 
11: loadNamespace(package, lib.loc) 
12: doTryCatch(return(expr), name, parentenv, handler) 
13: tryCatchOne(expr, names, parentenv, handlers[[1L]]) 
14: tryCatchList(expr, classes, parentenv, handlers) 
15: tryCatch({ attr(package, "LibPath") <- which.lib.loc ns <- loadNamespace(package, lib.loc) env <- attachNamespace(ns, pos = pos, deps)}, error = function(e) { P <- if (!is.null(cc <- conditionCall(e)))   paste(" in", deparse(cc)[1L]) else "" msg <- gettextf("package or namespace load failed for %s%s:\n %s",   sQuote(package), P, conditionMessage(e)) if (logical.return)   message(paste("Error:", msg), domain = NA) else stop(msg, call. = FALSE, domain = NA)}) 
16: library(tmap) 

Possible actions: 
1: abort (with core dump, if enabled) 
2: normal R exit 
3: exit R without saving workspace 
4: exit R saving workspace 
Selection: 

Я использую текущую версию Mac OS X Sierra (10.12.6) и R 3.4.1. Это происходит как в RStudio, так и в R GUI, который поставляется с R для Mac.

Смежные вопросы