Я пытаюсь объединить набор файлов с петлей For через каталог файлов.Bash For Loop с несколькими входными файлами с таким же именем
Файлы выглядят как samename.csfasta и samename.qual, только расширения разные.
Команда для выполнения программы является:
solid2fastq samename.csfasta samename.qual -o samename
Я искал для примера в Интернете, но не нашел.
если бы только один вход:
for f in $FILES
do
echo "Processing $f file....."
solid2fastq $f -o $f
done
ТИА
Я не понимаю. как выглядит вход в сценарий? что такое $ FILES? –
Итак, в начале скрипта я направляю его в папку с файлами. ФАЙЛЫ = ~/папка/папка/* Я не включил это извините. Используя ответ из pipi, я записываю cd в каталог с файлами в скрипте. –