2015-10-10 2 views
-1

Мне нужен выходной файл, содержащий 62 столбца, первый и второй столбцы из файла1 и остальные столбцы из столбца 7 других файлов ... я сделал это [izadi @ lbox161 subread-1.4 .6-p5-source] $ паста < (cut -f1,7 counts018347.txt) < (cut -f7 counts019035.txt) < (cut -f7 SRR074122.txt) < (cut -f7 SRR074123.txt) < (cut -f7 SRR314813.txt) < (вырезать -f7 SRR314814.txt) < (вырезать -f7 SRR314815.txt) < (вырезать -f7 SRR314819.txt) < (вырезать -f7 SRR331224.txt) < (вырезать -f7 SRR346552.txt) < (cut -f7 SRR346553.txt) < (cut -f7 SRR390313.txt) < (cutcd/usr /data/nfs6/izadi/microarray/subread-1.4.6-p5-source/ad-1.4.6-p5-source]$ paste < (cut -f1,7 counts018347.txt) < (cut -f7 counts019035.txt) < (cut -f7 SRR074122.txt)> summary.txt Слишком много ('s. [Izadi @ lbox161 subread-1.4.6-p5-источник] $Объединение столбцов из разных файлов

ответ

0

Вы можете использовать временные файлы, например:

cut -f1,7 counts018347.txt > tmp1 
cut -f7 counts019035.txt > tmp2 
cut -f7 SRR074122.txt  > tmp3 
cut ... 
paste tmp1 tmp2 tmp3 tmp...> summary.txt 
+0

спасибо за вашу помощь – Fereshteh

Смежные вопросы