1
Я пытаюсь установить «rgl» на CentOS 6.7, но я не могу заставить его работать.
Пила много подобных проблем, но решение для меня не работало.glEnd ошибка (mesa-libGL/GLU) установка пакета «rgl» на Centos6.7
Моя система:
Centos 6,7
R версии 3.2.3 (2015-12-10) - "Деревянная елочная"
Платформа: x86_64-RedHat-Linux-гну (64 -битовый)
ПРИМЕЧАНИЕ: проблема эволюционировали, вы можете перейти непосредственно к UPDATE части. Я переформатирую весь пост, когда проблема будет решена.
Ошибка (с использованием Bioconductor)
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rgl")
...
configure: error: X11 not found but required, configure aborted.
ERROR: configuration failed for package ‘rgl’
* removing ‘/usr/lib64/R/library/rgl’
же вопрос с помощью
install.packages("rgl", repos="http://R-Forge.R-project.org")
Я попытался решение здесь
How to install R “rgl” package under centos 6?
Вот мой установлен X11 библиотека:
>yum list installed |grep X11
libX11.x86_64 1.6.0-6.el6 @base
libX11-common.noarch 1.6.0-6.el6 @base
libX11-devel.x86_64 1.6.0-6.el6 @base
Но все еще не удается.
Я также установил devtools и импортированную библиотеку, это не исправило проблему.
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
library(devtools)
biocLite("rgl")
... same issue
Отработанные часы на ней, ничего не получалось
NB: Я успешно установил его на моем убунту, но нет никакого способа, чтобы сделать это работает на centos6.7 (рабочая станция)
UPDATE
Найти что Libpng-разви отсутствовал (уже, Libpng, libpng10, libpng10-разви)
sudo yum install libpng-devel.x86_64
Ошибка изменилась Затем я добавил еще недостающие библиотеки
sudo yum install mesa-libGL
sudo yum install mesa-libGL-devel
sudo yum install mesa-libGLU
sudo yum install mesa-libGLU-devel
ошибка изменилась я все еще имею проблему
* installing *source* package ‘rgl’ ...
** package ‘rgl’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc -m64 -std=gnu99
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables...
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -m64 -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -m64 -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -m64 -std=gnu99 -E
checking for gcc... (cached) gcc -m64 -std=gnu99
checking whether we are using the GNU C compiler... (cached) yes
checking whether gcc -m64 -std=gnu99 accepts -g... (cached) yes
checking for gcc -m64 -std=gnu99 option to accept ISO C89... (cached) none needed
checking whether __attribute__((visibility())) is supported... yes
checking whether gcc -m64 -std=gnu99 accepts -fvisibility... yes
checking whether accepts -fvisibility... no
checking for libpng-config... yes
configure: using libpng-config
configure: using libpng dynamic linkage
checking for X... libraries , headers
checking GL/gl.h usability... yes
checking GL/gl.h presence... yes
checking for GL/gl.h... yes
checking GL/glu.h usability... yes
checking GL/glu.h presence... yes
checking for GL/glu.h... yes
checking for glEnd in -lGL... no
configure: error: missing required library GL
ERROR: configuration failed for package ‘rgl’
Теперь, если я найти libGL
locate libGL
/usr/lib/libGL.la
/usr/lib/libGL.so
/usr/lib/libGL.so.1
/usr/lib/libGL.so.361.28
/usr/lib/libGLESv1_CM.so
/usr/lib/libGLESv1_CM.so.1
/usr/lib/libGLESv1_CM_nvidia.so.1
/usr/lib/libGLESv1_CM_nvidia.so.361.28
/usr/lib/libGLESv2.so
/usr/lib/libGLESv2.so.2
/usr/lib/libGLESv2_nvidia.so.2
/usr/lib/libGLESv2_nvidia.so.361.28
/usr/lib/libGLX_indirect.so.0
/usr/lib/libGLX_nvidia.so.0
/usr/lib/libGLX_nvidia.so.361.28
/usr/lib/libGLdispatch.so.0
/usr/lib64/libGL.la
/usr/lib64/libGL.so
/usr/lib64/libGL.so.1
/usr/lib64/libGL.so.361.28
/usr/lib64/libGLESv1_CM.so
/usr/lib64/libGLESv1_CM.so.1
/usr/lib64/libGLESv1_CM_nvidia.so.1
/usr/lib64/libGLESv1_CM_nvidia.so.361.28
/usr/lib64/libGLESv2.so
/usr/lib64/libGLESv2.so.2
/usr/lib64/libGLESv2_nvidia.so.2
/usr/lib64/libGLESv2_nvidia.so.361.28
/usr/lib64/libGLU.so
/usr/lib64/libGLU.so.1
/usr/lib64/libGLU.so.1.3.1
/usr/lib64/libGLX_indirect.so.0
/usr/lib64/libGLX_nvidia.so.0
/usr/lib64/libGLX_nvidia.so.361.28
/usr/lib64/libGLdispatch.so.0
/usr/lib64/libGLw.so
/usr/lib64/libGLw.so.1
/usr/lib64/libGLw.so.1.0.0
/usr/share/doc/mesa-libGLw-6.5.1
/usr/share/doc/mesa-libGLw-6.5.1/README
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/changed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_data
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_type
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/command_line
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_revision
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_timestamp
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/installed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/reason
/var/lib/yum/yumdb/m/010c511f597ab7af9a62cb69e3efa97a86d8aed8-mesa-libGLU-10.4.3-1.el6-x86_64/releasever
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/checksum_data
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/checksum_type
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/command_line
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/from_repo
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/from_repo_revision
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/from_repo_timestamp
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/installed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/reason
/var/lib/yum/yumdb/m/a38f4280f482ab6f663312b4971b2355c27dedc6-mesa-libGLw-6.5.1-10.el6-x86_64/releasever
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/changed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_data
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_type
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/command_line
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_revision
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_timestamp
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/installed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/reason
/var/lib/yum/yumdb/m/aa6576ce41dd030b88b08c1a166b3a367f685972-mesa-libGL-10.4.3-1.el6-x86_64/releasever
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_data
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_type
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/command_line
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_revision
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_timestamp
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/installed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/reason
/var/lib/yum/yumdb/m/adc9d6749b6c635c773e81565cd5d39b0ab3b851-mesa-libGL-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/releasever
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_data
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/checksum_type
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/command_line
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_revision
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/from_repo_timestamp
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/installed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/reason
/var/lib/yum/yumdb/m/dc1a62e08fc366e4a97e261f5dc94d04019e1e68-mesa-libGLU-devel-10.4.3-1.el6-x86_64/releasever
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/checksum_data
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/checksum_type
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/command_line
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/from_repo
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/from_repo_revision
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/from_repo_timestamp
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/installed_by
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/reason
/var/lib/yum/yumdb/m/edbad91b2990d0cab1c3e8a029bcd7129ce3a1e5-mesa-libGLw-devel-6.5.1-10.el6-x86_64/releasever
UPDATE2:
После @MartinMorgan помощи я скачал пакет ligGL и настроен вручную
./configure
дал мне
configure: error: Direct rendering requires libdrm >= 2.4.38
Так что я должен был установить libdrm-Devel
sudo yum install libdrm-devel
Затем еще раз, обновление ошибка!
configure: error: DRI3 requires xcb >= 1.9.3
Но CentOS имеет 1.9.1 установлен
я решил сделать это вручную
wget https://xcb.freedesktop.org/dist/libxcb-1.9.3.tar.gz
Но когда я ударил настроить, он сказал мне, что он нуждается в XCB-прото 1,9
Репозиторий Yum для centOS6 предоставляет только 1,8
Еще раз я пошел вручную
wget https://xcb.freedesktop.org/dist/xcb-proto-1.9.tar.gz
Но когда я его установлю и вернусь к libxcb-1.9.3, он не обнаружит, что установлен xcb-proto.
Принимая во внимание, что если я установил 1.8 xcb-proto из репозитория, он обнаружит его и скажет, что он устарел.
Глядя, когда XCB-прото 1,8 установлен с
rpm -ql xcb-proto
выход является
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/__init__.py
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/__init__.pyc
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/__init__.pyo
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/error.py
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/error.pyc
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/error.pyo
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/expr.py
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/expr.pyc
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/expr.pyo
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/matcher.py
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/matcher.pyc
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/matcher.pyo
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/state.py
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/state.pyc
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/state.pyo
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/xtypes.py
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/xtypes.pyc
/usr/lib/python2.6/site-packages/xcbgen/xtypes.pyo
/usr/share/doc/xcb-proto-1.8
/usr/share/doc/xcb-proto-1.8/COPYING
/usr/share/doc/xcb-proto-1.8/NEWS
/usr/share/doc/xcb-proto-1.8/README
/usr/share/doc/xcb-proto-1.8/TODO
/usr/share/doc/xcb-proto-1.8/xml-xcb.txt
/usr/share/pkgconfig/xcb-proto.pc
/usr/share/xcb
/usr/share/xcb/bigreq.xml
/usr/share/xcb/composite.xml
/usr/share/xcb/damage.xml
/usr/share/xcb/dpms.xml
/usr/share/xcb/dri2.xml
/usr/share/xcb/ge.xml
/usr/share/xcb/glx.xml
/usr/share/xcb/randr.xml
/usr/share/xcb/record.xml
/usr/share/xcb/render.xml
/usr/share/xcb/res.xml
/usr/share/xcb/screensaver.xml
/usr/share/xcb/shape.xml
/usr/share/xcb/shm.xml
/usr/share/xcb/sync.xml
/usr/share/xcb/xc_misc.xml
/usr/share/xcb/xcb.xsd
/usr/share/xcb/xevie.xml
/usr/share/xcb/xf86dri.xml
/usr/share/xcb/xf86vidmode.xml
/usr/share/xcb/xfixes.xml
/usr/share/xcb/xinerama.xml
/usr/share/xcb/xinput.xml
/usr/share/xcb/xkb.xml
/usr/share/xcb/xprint.xml
/usr/share/xcb/xproto.xml
/usr/share/xcb/xselinux.xml
/usr/share/xcb/xtest.xml
/usr/share/xcb/xv.xml
/usr/share/xcb/xvmc.xml
В то время как XCB-прото использования питона 2,7
Я не очень хорошо понимают разницу между тем, как система находит пакеты, установленные yum, и как они их обнаруживают, когда они установлены из tarball.
Check [этот похожий вопрос] (http://stackoverflow.com/questions/31820865/error-in-installing-rgl-package) Сообщение может появиться, если xquartz отсутствует –
я думал, что кварц был для macOS я посмотрю – zakrapovic
, это может помочь предоставить еще несколько строк до 'configure: error', чтобы указать, что настроит для поиска X11. –