Кубизм с геномными данными (или несерийными данными)

Я хотел бы услышать ваши мысли о том, что нужно сделать, чтобы кубизм работал с данными, не относящимися к таймеру, конкретно, геномными данными.Кубизм с геномными данными (или несерийными данными)

Этот тип данных имеет локус (хромосома и координаты в этой хромосоме) вместо временной метки:

chrm1 145678123 value 
chrm12 45345 value 
chrmX 4535 value 
....

Какой вариант вы считаете лучшим, хакерство ядро кубизма, чтобы позволить этим типом данных (или любого типа данных, если на то пошло) или нереста нового проекта вместе?

ОБНОВЛЕНИЕ: Я решил реализовать модифицированную версию кубизма для ДНК. Я называю это ДНКтизмом, и вы можете найти его here. Взгляните и дайте мне знать, что вы думаете.

-drd

источник

2013-07-24 drio

Я работаю над аналогичной проблемой: как отображать геномные данные через d3. Был бы заинтересован в решении. – ardochhigh

Проверьте мое решение [здесь] (https://github.com/drio/dnaism). – drio

кубизм, вероятно, не правильный вид библиотеки для выполнения этой задачи. Вам придется изменить библиотеку довольно значительным образом. Вместо этого я бы рекомендовал использовать плагин d3.horizon, чтобы вы могли получить намного больше контроля, создав пользовательские шкалы.

Надеюсь, это ответит на ваш вопрос.

источник

2013-07-25 12:01:25

Спасибо за ответ. – drio

Спасибо за ответ. Изменения могут быть сложными, но проблема, которую кубизм решает, в основном совпадает с тем, что я пытаюсь сделать. В настоящее время я просматриваю код. Посмотрим, будет ли кто-то еще весить. – drio

Кубизм с геномными данными (или несерийными данными)

ответ

Смежные вопросы