Matlab - анализ PCA

Question

У меня есть матрица размером 21x5 (top5features), содержащая значения для 5 различных типов объектов, извлеченных из 21 узелка рака. Я пытаюсь применить анализ основных компонентов для своих данных и распечатать результаты, но мне трудно понять, как это сделать. Ниже мой код до сих пор, но это только участки части данных, и я не считаю, что это то, что я собираюсь для:

top5features = features(1:21,[42 55 61 62 60]); 
[W, pc] = princomp(top5features); 
pc = pc'; W = W'; 
plot(pc(1,:),pc(2,:),'.'); 
title('{\bf PCA} of Top 5 Features') 

Моей цели сделать сюжет так, что он имеет 21 очков , причем каждая точка относится к конкретному узлу. Эти 21 узелки также разделены на две группы, и, если возможно, я хотел бы покрасить их в соответствии с группой, к которой они принадлежат. Я немного начинаю использовать Matlab, и любая помощь будет оценена.

Answer 1

С учетом ваших комментариев первые 10 столбцов разложенных данных PCA обозначают одну группу, в то время как последние 11 столбцов разложенных данных PCA обозначают другую группу. Это может быть просто сделать в одной plot команды, как это так, используя ваш код раньше:

%// Your code 
top5features = features(1:21,[42 55 61 62 60]);  
[W, pc] = princomp(top5features);  
pc = pc'; W = W'; 

%// Group 1 
group1 = pc(:,1:10); 
%// Group 2 
group2 = pc(:,11:21); 

%// Plot as separate colours 
plot(group1(1,:), group1(2,:), 'b.', group2(1,:), group2(2,:), 'r.');  
title('{\bf PCA} of Top 5 Features') 
legend('Group 1', 'Group 2'); 

Приведенный выше код первого разделяет ваши PCA уменьшенные данные на две группы, которые вы указали. Затем мы используем одну команду plot, чтобы отображать обе группы вместе на одном графике, но цвет мы их различаем. Синий для группы 1, а красный - для группы 2. Мы помещаем точки в каждую точку. В качестве бонуса мы добавляем легенду, которая обозначает, к какой группе принадлежит каждая точка.

Надеюсь, это поможет!