2016-02-22 2 views
0

У меня есть набор данных, который представляет собой двумерные данные с именами столбцов в качестве атрибутов и строк как элементов. Образец приведен ниже:атрибуты кластера с использованием hclust в R

 A1 A2 A3 A4 .... 
Item1 0  1  0 0 
Item2 0  0  0 1 
Item3 1 1  0 0 

....

Я использовал hclust (метод ward.D2) для создания кластера дендрограммы в R. я могу получить этикетки всех элементов в кластере , Как узнать список атрибутов (A1 A2 и т. Д.) Кластера, чтобы я мог определить, как эти элементы собрались вместе?

Код, который я попробовал это:

d <- vegdist(data,method="jaccard") 
fit <- hclust(d,method="ward.D2") 
plot(fit) 
hcd <- as.dendrogram(fit) 
plot(cut(hcd,h=3)$upper) 
labels(cut(hcd, h=3)$lower[[1]]) 

ответ

2

Иерархическая кластеризация не обрабатывает столбцы.

Работает на матрице - больше нет меток столбцов.

Возможно, вы ищете вместо biclustering.

+0

Спасибо. Любые хорошие ссылки для бикластеризации? – user2076038

+0

Начать с Cheng & Church. –

Смежные вопросы