Прежде всего, как предлагает Джордон Филлипс, проверьте, используете ли вы в Pycharm один и тот же интерпретатор.
Вы можете просто проверить это в настройках -> Проект -> Переводчик проекта.
Если это не то же самое, выберите правильный и попробуйте.
В противном случае, если это уже одно и то же, попробуйте удалить из pp и переустановить его непосредственно в Pycharm.
Перейдите в Настройки -> Проект -> Переводчик проекта, выберите правильный и нажмите значок плюса в правом углу окна.
После этого попробуйте использовать его как обычно.
Пожалуйста, дайте мне знать.
Ваш проект pycharm настроен на использование того же самого интерпретатора, который вы установили boto? –