Ближайшие соседи по Python с заданной матрицей расстояний

Question

Мне нужно применить Nearest Neighbors in Python, и я ищу объявления scikit-learn и библиотеки scipy, которые требуют данных в качестве входных данных, затем будут вычислять расстояния и применять алгоритм.

В моем случае мне пришлось вычислять нестандартное расстояние, поэтому я хотел бы знать, есть ли способ напрямую передать матрицу расстояний.

Answer 1

Вы хотите создать DistanceMetric объект, снабжая свою собственную функцию в качестве аргумента:

metric = sklearn.neighbors.DistanceMetric.get_metric('pyfunc', func=func) 

Из документов:

Здесь func это функция, которая принимает два одномерными numpy массивов, и возвращает расстояние. Обратите внимание, что для того, чтобы использовать в BallTree, расстояние должно быть истинная метрика: т.е. она должна удовлетворять следующие свойства

• Неотрицательность: д (х, у)> = 0
• идентичность: d (x, y) = 0 тогда и только тогда, когда x == y
• Симметрия: d (x, y) = d (y, x)
• Треугольник Неравенство: d (x, y) + d (y , г)> = d (х, г)

Вы можете создать классификатор с metric=metric как аргумент ключевого слова, и он будет использовать это при расчете расстояний.

Answer 2

Как указано фордом, и согласно документации http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier.html#sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier вы должны преобразовать свое пользовательское расстояние в объект DistanceMetric и передать его в качестве параметра метрики.

Answer 3

Хочет добавить ответ Форда, что вы должны сделать, как этот

метрического = DistanceMetric.get_metric («pyfunc», Func =/ваше имя функции /)

Вы не можете просто поставить свою собственную функцию как второй аргумент, вы должны назвать аргумент как «func»