2012-03-14 19 views
4

Я хотел бы скомпилировать стороннее программное обеспечение, но я столкнулся с проблемой с ZLIB.Проблемы с компиляцией с ZLIB

Смотрите ниже:

$sudo make 
    gcc -Wall -pedantic -DVERSION=1.2 -lz -O3 sliding.o trim_single.o trim_paired.o sickle.o -o sickle 
    trim_paired.o: In function `ks_getuntil': 
    trim_paired.c:(.text+0x78): undefined reference to `gzread' 
    trim_paired.o: In function `kseq_read': 
    trim_paired.c:(.text+0x48d): undefined reference to `gzread' 
    trim_paired.c:(.text+0x4dc): undefined reference to `gzread' 
    trim_paired.c:(.text+0x60a): undefined reference to `gzread' 
    trim_paired.c:(.text+0x687): undefined reference to `gzread' 
    trim_paired.o: In function `paired_main': 
    trim_paired.c:(.text+0xc62): undefined reference to `gzopen' 
    trim_paired.c:(.text+0xc83): undefined reference to `gzopen' 
    trim_paired.c:(.text+0x1142): undefined reference to `gzclose' 
    trim_paired.c:(.text+0x114f): undefined reference to `gzclose' 
    trim_single.o: In function `ks_getuntil': 
    trim_single.c:(.text+0x78): undefined reference to `gzread' 
    trim_single.o: In function `single_main': 
    trim_single.c:(.text+0x688): undefined reference to `gzopen' 
    trim_single.c:(.text+0x8ad): undefined reference to `gzread' 
    trim_single.c:(.text+0x8f5): undefined reference to `gzread' 
    trim_single.c:(.text+0xb11): undefined reference to `gzread' 
    trim_single.c:(.text+0xb96): undefined reference to `gzread' 
    trim_single.c:(.text+0xc58): undefined reference to `gzclose' 
    collect2: ld returned 1 exit status 
    make: *** [build] Error 1 

Я использую Ubuntu, и я установить ZLIB 1.2.6 в/USR/местные/Библиотека

Вот в Makefile:

PROGRAM_NAME = sickle 
VERSION = 1.2 
CC = gcc 
CFLAGS = -Wall -pedantic -DVERSION=$(VERSION) 
DEBUG = -g 
OPT = -O3 
ARCHIVE = $(PROGRAM_NAME)_$(VERSION) 
LDFLAGS = -lz 
SDIR = src 

.PHONY: clean default build distclean dist debug 

default: build 

sliding.o: $(SDIR)/sliding.c $(SDIR)/kseq.h $(SDIR)/sickle.h 
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c 

trim_single.o: $(SDIR)/trim_single.c $(SDIR)/sickle.h $(SDIR)/kseq.h 
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c 

trim_paired.o: $(SDIR)/trim_paired.c $(SDIR)/sickle.h $(SDIR)/kseq.h 
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c 

sickle.o: $(SDIR)/sickle.c $(SDIR)/sickle.h 
    $(CC) $(CFLAGS) $(OPT) -c $(SDIR)/$*.c 

clean: 
    rm -rf *.o $(SDIR)/*.gch ./sickle 

distclean: clean 
    rm -rf *.tar.gz 

dist: 
    tar -zcf $(ARCHIVE).tar.gz src Makefile 

build: sliding.o trim_single.o trim_paired.o sickle.o 
    $(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) $(OPT) $? -o sickle 

debug: 
    $(MAKE) build "CFLAGS=-Wall -pedantic -g -DDEBUG" 

Любой помощь приветствуется;)

Thanks

+0

Почему вы не используете системные пакеты 'zlib1g' и' zlib1g-dev'? – sarnold

+0

@sarnold: zlib1g уже установлен, меня просто смутили «zlib» и «zlib1g». Не знаю, точно ли они одинаковы ... – pasta

+0

Хех, это изменение было сделано еще в 1998 году (судя по «apt-get changelog zlib1g») - практически во время, когда 'libc5' был заменен на' libc6'. Может быть, они связаны? Если ваша программа компилируется после запуска 'apt-get install zlib1g-dev', вы можете игнорировать свою версию в'/usr/local/'. – sarnold

ответ

6

Я нашел ответ сам! Он работает путем изменения:

$(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) $(OPT) $? -o sickle 

в

$(CC) $(CFLAGS) $(OPT) $? -o sickle $(LDFLAGS) 

-lz вариант должен быть в конце.

Смежные вопросы