значения NA не исключенные в `cor`

Question

Для упрощения, у меня есть набор данных, который выглядит следующим образом:

b <- 1:6 
# > b 
# [1] 1 2 3 4 5 6 
jnk <- c(2, 4, 5, NA, 7, 9) 
# > jnk 
# [1] 2 4 5 NA 7 9 

Когда я пытаюсь:

cor(b, jnk, na.rm=TRUE) 

я получаю:

> cor(b, jnk, na.rm=T) 
    Error in cor(b, jnk, na.rm = T) : unused argument (na.rm = T) 

Я также пробовал na.action = na.exclude и т. Д. Нет, похоже, работает. Было бы очень полезно узнать, в чем проблема, и как я могу это исправить. Благодарю.

Answer 1

Читать ?cor:

cor(x, y = NULL, use = "everything", 
    method = c("pearson", "kendall", "spearman")) 

Он не имеет na.rm, он имеет use.

необязательная символьная строка, дающая метод вычисления ковариаций при наличии отсутствующих значений. Это должно быть (аббревиатура) одной из строк "everything", "all.obs", "complete.obs", "na.or.complete", или "pairwise.complete.obs".

Выберите один. Подробная информация о том, что делает каждый, находится в разделе Details от ?cor.

Answer 2

Просто убедитесь, что ответ на этот вопрос ясен.

Игнорирование NA, используйте

b <- 1:6 
jnk <- c(2, 4, 5, NA, 7, 9) 
cor(b, jnk, use="complete.obs") 
[1] 0.9905977