2016-11-26 3 views
1

У меня есть набор pmid. Я хотел бы узнать, можно ли получить информацию, такую ​​как название, журнал, выпуск, номер страницы и реферат?как я могу получить информацию из pubmed

# Sample data 
pmid<-c(8339401,8485120,8427851,3418853,3195585,2643302,7947591,8274474,8243847) 

ответ

1

Попробуйте это:

library(RISmed) 

e <- EUtilsGet(pmid) 

ArticleTitle(e) 
MedlineTA(e) 
Volume(e) 
Issue(e) 
AbstractText(e) 
MedlinePgn(e) 
PMID(e) # same as pmid in question except character class 

help(package = RISmed) 
str(e) 

Google Также для: RISmed

Например:

> library(RISmed) 
> e <- EUtilsGet(pmid) 
> ArticleTitle(e) 
[1] "LDL subclass phenotypes and the insulin resistance syndrome in women."                 
[2] "Genetics of LDL subclass phenotypes in women twins. Concordance, heritability, and commingling analysis."        
[3] "Effect of hepatic lipase on LDL in normal men and those with coronary artery disease."             
[4] "Low-density lipoprotein subclass patterns and risk of myocardial infarction."               
[5] "Inheritance of low-density lipoprotein subclass patterns: results of complex segregation analysis."          
[6] "Plasma triglyceride as a risk factor for coronary heart disease. The epidemiologic evidence and beyond."        
[7] "Genetic predictors of FCHL in four large pedigrees. Influence of ApoB level major locus predicted genotype and LDL subclass phenotype." 
[8] "Lack of association between sex hormones and Lp(a) concentrations in American and Finnish men."           
[9] "Is microalbuminuria part of the prediabetic state? The Mexico City Diabetes Study." 
+0

ли вы установить и загрузить пакет? «Pmid» идентичен тому, что вы показали в вопросе? Это сработало для меня. –

+0

Я нашел, где проблема. Мне пришлось переустановить пакет, потому что он был старым или я не знаю, что. Один вопрос, можно ли добавить всю эту информацию перед каждым заголовком. например, первую бумагу, заголовок, выпуск, объем, страницу, а затем абстрактную. Тогда ниже этого, для другого и т. Д.? – nik

+0

'data.frame (title = ArticleTitle (e), ... etc ..., stringsAsFactors = FALSE)'. –

Смежные вопросы