2010-08-24 3 views
8

У меня есть многослойную areaplot сделанный с ggplot2:ggplot2: наложение контрольной группы линия на графике панели установлен

dists.med.areaplot<-qplot(starttime,value,fill=dists,facets=~groupname, 
    geom='area',data=MDist.median, stat='identity') + 
    labs(y='median distances', x='time(s)', fill='Distance Types')+ 
    opts(title=subt) + 
    scale_fill_brewer(type='seq') + 
    facet_wrap(~groupname, ncol=2) + grect #grect adds the grey/white vertical bars 

Это выглядит следующим образом: stacked area graph

Я хочу, чтобы добавить наложение профиля (внизу справа) ко всем графикам на выходе (groupname == rowH является элементом управления).

До сих пор мои лучшие усилия принесли это:

cline<-geom_line(aes(x=starttime,y=value), 
    data=subset(dists.med,groupname=='rowH'),colour='red') 

dists.med.areaplot + cline 

problem graph

мне нужны 3 красные линии, чтобы быть 1 красная линия, которая скользит в верхней части темно-синий разделе. И мне нужна эта идентичная строка (строка rowH) для наложения каждой из панелей.

dataframe выглядит следующим образом:

> str(MDist.median) 
'data.frame': 2880 obs. of 6 variables: 
$ groupname: Factor w/ 8 levels "rowA","rowB",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ fCycle : Factor w/ 6 levels "predark","Cycle 1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ fPhase : Factor w/ 2 levels "Light","Dark": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ... 
$ starttime: num 0.3 60 120 180 240 300 360 420 480 540 ... 
$ dists : Factor w/ 3 levels "inadist","smldist",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ value : num 110 117 115 113 114 ... 

красная линия должна быть рассчитана как сумма value на каждом STARTTIME, где имя_группы = «rowH». Я попытался создать cline следующими способами. Каждый из них приводит к ошибке или неправильному выводу:

#sums the entire y for all points and makes horizontal line 
cline<-geom_line(aes(x=starttime,y=sum(value)),data=subset(dists.med,groupname=='rowH'),colour='red') 

#using related dataset with pre-summed y's 
> cline<-geom_line(aes(x=starttime,y=tot_dist),data=subset(t.med,groupname=='rowH')) 
> dists.med.areaplot + cline 
Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'dists' not found 

Мысли?

ETA:

Похоже, что проблема у меня была с 'dists' not found связано с тем, что начальный участок, dists.med.areaplot был создан с помощью qplot. Чтобы избежать этой проблемы, я не могу построить на qplot. Это код для рабочего участка:

cline.data <- subset(
     ddply(MDist.median, .(starttime, groupname), summarize, value = sum(value)), 
     groupname == "rowH") 
cline<-geom_line(data=transform(cline.data,groupname=NULL), colour='red') 

dists.med.areaplot<-ggplot(MDist.median, aes(starttime, value)) + 
    grect + nogrid + 
    geom_area(aes(fill=dists),stat='identity') + 
    facet_grid(~groupname)+ scale_fill_brewer(type='seq') + 
    facet_wrap(~groupname, ncol=2) + 
    cline 

в результате этого graphset: alt text

ответ

3

Этот блог обучения R должен иметь некоторую помощь:

http://learnr.wordpress.com/2009/12/03/ggplot2-overplotting-in-a-faceted-scatterplot/

Это может быть стоит вычислить сводку за пределами ggplot с plyr.

cline.data <- ddply(MDist.median, .(starttime, groupname), summarize, value = sum(value)) 
cline.data.subset <- subset(cline.data, groupname == "rowH") 

Затем добавить его к сюжету с

last_plot() + geom_line(data = transform(cline.data.subset, groupname = NULL), color = "red") 
+0

Я не думаю, что вы хотите удалить 'groupname' переменную. – hadley

+0

Если вы удалите 'groupname', не будет ли это построение линии по всем граням? – JoFrhwld

+0

Хм, может, я неправильно понял вопрос. – hadley

Смежные вопросы