Основы DICOM для объемных данных

Я рассмотрел некоторые из стандартов DICOM и страницы в Википедии (и все темы DICOM на SO), но, не впиваясь в файловую структуру doc (ugh), меня путают то, что точно хранится в файле DICOM для сканирования, содержащего данные 3D/4D/5D. Мне нужен только обзор.Основы DICOM для объемных данных

Давайте возьмем МРТ в качестве примера. Имеет ли файл DICOM содержат

набор исходных 2D-изображений, снятых с разных ракурсов
стопка ломтиками, образующих 3D вокселей набора данных
полный 3D набор данных

Другими словами , делает ли DICOM какой-либо постобработки на необработанных изображениях, снятых машиной формирования изображений?

Насколько 4D, предположительно это просто набор из нескольких 3D-наборов данных, каждый «кадр» представляет собой отдельный набор данных?

источник

2010-12-13 Mr. Boy

DICOM «стандарт» имеет в своем распоряжении множество различных опций, наряду с расширениями поставщиков, что позволяет большинство вещей.

Тем не менее, большинство трехмерных наборов данных DICOM, с которыми я столкнулся, представляют собой двухмерные изображения. Для последующей обработки это зависит исключительно от устройства обработки изображений.

Если вы ищете свободно доступную библиотеку DICOM, вы можете попробовать GDCM, я был довольно доволен ею.

источник

2010-12-13 17:30:08 tkerwin

+1 да, это почти, но не совсем, совсем не похоже на стандарт. –

GDCM - это тот, на который я смотрел, но я немного потерял то, что он делает, и не поддерживает. Итак, по сути, я могу _typically_ ожидать набор отдельных изображений JPG? –

В принципе, да.Проблема состоит в том, что часто несколько стеков сбрасываются в один и тот же каталог с бесполезными именами файлов. Вам нужно использовать теги (серия, позиция изображения и т. Д.), Чтобы выяснить, что происходит. – tkerwin

Оригинальный формат DICOM MR содержит одиночное, двумерное изображение. Этот формат по-прежнему широко поддерживается, вполне вероятно, что у вас есть. Если это -, то у вас есть, то вы захотите собрать все изображения в серии, чтобы построить свой том.

Новый, улучшенный формат МР-изображений способен хранить весь том в виде многокадрового изображения. Если да, это ваш том. Я не помню, должен ли один расширенный объект MR быть целым рядом или нет.

Вы можете сказать им друг от друга, глядя на DICOM атрибут SOP класса UID (0008,0016):

Original MR: 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4 
Enhanced MR: 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

Выше, когда я сказал, что вы, возможно, потребуется собрать «все изображения в серии «для создания тома, это означает, что вы используете изображения, которые имеют одно и то же значение для идентификатора экземпляра класса экземпляра (0020 000E).

Примечания:

DICOM пуристы предпочитают термин «Image Information Определение объекта» вместо слова «формат», как я его помощью.
Пуристы DICOM возражают против утверждения, что идентификатор SOP-класса определяет формат изображения. Для ваших целей это сработает.

источник

2011-04-19 21:56:41

Основы DICOM для объемных данных

ответ

Смежные вопросы