2015-01-06 3 views
0

Я пытаюсь преобразовать объект graphNEL в кадр данных, есть ли способ сделать это?Как преобразовать графNEL-объект в фрейм данных?

Я попытался

dataframe <- as.data.frame(get.edgelist(graphnel)) 

, но я получил сообщение об ошибке, что он не является объектом графа (graphnel это имя моей переменной, содержащей объект graphNEL)

+0

Просьба привести воспроизводимый пример. Это похоже на то, что вы смешиваете объекты и функции из пакетов ** graph ** и ** igraph **, но это трудно сказать без какого-либо воспроизводимого кода. –

+0

это мой код: https://github.com/materechm/Bioinformatics/blob/master/pathways.R – user3089079

ответ

0

Вы должны преобразовать graphnel в igraph первый. dataframe < - as.data.frame (get.edgelist (igraph.from.graphNEL (graphnel)))

Удачи.

Смежные вопросы