У меня есть два файла file1.txt и file2.txt.Сравните два файла и напечатайте соответствующие строки с некоторыми строками после соответствия
file1.txt
DS496218 40654 42783
DS496218 40654 42783
DS496218 40654 42783
file2.txt
###
DS496108 ena gene 99942 102567 . -
DS496128 ena mRNA 99942 102567 . -
DS496118 ena three_prime_UTR 99942 100571
###
DS496218 ena gene 40654 42783 . -
DS496108 ena mRNA 99942 102567 . -
DS496108 ena three_prime_UTR 99942 100571
###
DS496128 ena gene 99942 102567 . -
DS496133 ena mRNA 99942 102567 . -
DS496139 ena three_prime_UTR 99942 100571
###
Я хочу, чтобы соответствовать колонки 1,2 и 3 file1.txt с колонки 1,4 и 5 file2.txt. Если он соответствует печати соответствующей строки со следующими строками до ###
, но не печатайте ###
. Я попробовал его с помощью команды «AWK» в
awk -F'\t' 'NR==FNR{c[$1$2$3]++;next};c[$1$4$5] > 0' file1.txt file2.txt > out.txt.
Попробуйте использовать опцию «в». то есть: $ 1 $ 4 $ 5 в c {do stuff here} – grail
попробуйте с 'awk 'NR == FNR {c [$ 1 $ 2 $ 3] ++; next} $ 1 $ 4 $ 5 в c 'file1.txt RS = "###" file2.txt' –
[изменить] ваш вопрос включить ожидаемый результат с учетом ввода. @JoseRicardoBustosM. no, никогда не объединяйте поля для создания ключевой строки, если у вас нет очень конкретной цели, так как это создает ложные совпадения - рассмотрите 'a bc' ->' abc' и 'ab c' ->' abc'. Кроме того, установка RS на несколько символов сделает скрипт ненужным gawk-specific и будет печатать строки до матча, а также после. –