Как создать простую карту тепла в R

Я не могу на всю жизнь понять, как это сделать, но похоже, что это должно быть довольно просто.Как создать простую карту тепла в R

У меня есть следующие данные:

A B C 

5 2 0.714972409 
5 4 0.74183882 
5 6 0.762162036 
5 8 0.813707009 
5 10 0.850703046 
5 12 0.857035156 
5 14 0.872640528 
5 16 0.973139763 
5 18 0.978478338 
7 2 0.684788926 
7 4 0.711897491 
7 6 0.735098842 
7 8 0.762857648 
7 10 0.83291045 
7 12 0.844075508 
7 14 0.884207251 
7 16 0.94815451 
7 18 0.950971496 
9 2 0.659268067 
9 4 0.694214759 
9 6 0.718271051 
9 8 0.771301281 
9 10 0.773598055 
9 12 0.836032827 
9 14 0.870630437 
9 16 0.877580987 
9 18 0.929563158 
11 2 0.662650697 
11 4 0.670933715 
11 6 0.689340083 
11 8 0.693320771 
11 10 0.750268847 
11 12 0.786759112 
11 14 0.827402884 
11 16 0.87493501 
11 18 0.909695854 
13 2 0.626547156 
13 4 0.633140699 
13 6 0.682464618 
13 8 0.702283534 
13 10 0.756709989 
13 12 0.768034027 
13 14 0.815414298 
13 16 0.868304111 
13 18 0.857143204 
15 2 0.642907947 
15 4 0.664392516 
15 6 0.683305068 
15 8 0.706409063 
15 10 0.729998833 
15 12 0.752115586 
15 14 0.775292453 
15 16 0.801494475 
15 18 0.883794201 
17 2 0.605458303 
17 4 0.621560397 
17 6 0.648538727 
17 8 0.665378929 
17 10 0.695163292 
17 12 0.713840128 
17 14 0.762558649 
17 16 0.835615372 
17 18 0.845147592 
19 2 0.573326068 
19 4 0.599060774 
19 6 0.615440659 
19 8 0.649463687 
19 10 0.674024337 
19 12 0.72427247 
19 14 0.747894393 
19 16 0.77787273 
19 18 0.796066305 
21 2 0.576442958 
21 4 0.565737836 
21 6 0.602169915 
21 8 0.642909046 
21 10 0.645458282 
21 12 0.691301146 
21 14 0.727324617 
21 16 0.775556108 
21 18 0.817496666 
23 2 0.533171689 
23 4 0.565956771 
23 6 0.620844768 
23 8 0.616694919 
23 10 0.633368894 
23 12 0.669562089 
23 14 0.680912205 
23 16 0.722211534 
23 18 0.765015031 
25 2 0.52308274 
25 4 0.563778286 
25 6 0.564340285 
25 8 0.610685424 
25 10 0.600061306 
25 12 0.655410805 
25 14 0.684528361 
25 16 0.71358848 
25 18 0.740716841 
27 2 0.520854189 
27 4 0.538261912 
27 6 0.560022949 
27 8 0.592117652 
27 10 0.59707951 
27 12 0.630212317 
27 14 0.653396447 
27 16 0.689859539 
27 18 0.719597316 
29 2 0.504173709 
29 4 0.529294427 
29 6 0.553966747 
29 8 0.561650807 
29 10 0.609853393 
29 12 0.597217807 
29 14 0.631877662 
29 16 0.675602795 
29 18 0.676468158 
31 2 0.488265133 
31 4 0.495376458 
31 6 0.507751424 
31 8 0.528459137 
31 10 0.546474587 
31 12 0.599001653 
31 14 0.620699739 
31 16 0.621521091 
31 18 0.664893468 
33 2 0.464415592 
33 4 0.50818927 
33 6 0.485845473 
33 8 0.506436638 
33 10 0.529943976 
33 12 0.568978775 
33 14 0.5816666 
33 16 0.599533467 
33 18 0.628195086

И я хочу, чтобы создать Heatmap где А ось х, В по оси у, а цвет зависит от C. Я также хочу чтобы можно было установить цветовую гамму (желательно оттенки зеленого) и создать легенду.

Я использовал this post, чтобы сделать тепловую карту, которая была очень похожа на показанную там, но я не знаю, как ее перекрасить или дать легенде другой заголовок.

Спасибо!

источник

2015-03-10 japem

Звучит как работа для 'image'. –

Что вы пробовали? Что вы получили от чтения документации для qplot? Что случилось, когда вы googled «изменить легенду qplot»? – Elin

Вы можете сделать это с помощью функции ggplot() следующим образом. Здесь я предполагаю, что ваши данные находятся в фрейме данных, который называется d.

library(ggplot2) 

ggplot(d, aes(x=A, y=B, fill=C)) + 
    geom_tile() + 
    scale_fill_gradient(low="white", high="darkgreen", name="Your Legend")

enter image description here

Графика, сделанная с ggplot() высоко настраиваемая и документация хорошо, так что это должно быть хорошей отправной точкой, если ничего другого.

источник

2015-03-10 00:29:09

Да, спасибо! Я знаю, что это немного поздно, но это сработало, на самом деле я использовал scale_fill_gradient2(), но спасибо за подсказку. – japem

@japem: Рад, что это сработало для вас. –

Использование qplot (со ссылкой на сообщение, которое Вы упоминалось в вашем вопросе), и scale_fill_gradient() можно указать цветовой оттенок и описание легенды Вашего участка:

library(ggplot2) 
qplot(x = A, y = B, data = df, fill = C, geom = "tile") + 
scale_fill_gradient("lightgreen", "darkgreen", name = "CUSTOM LEGEND")

enter image description here

В качестве альтернативы, вы можете использовать ggvis:

library(ggvis) 
df %>% 
    ggvis(~factor(A), ~factor(B), fill=~C) %>% 
    layer_rects(width = band(), height = band(), strokeWidth := 0) %>% 
    scale_nominal("x", padding = 0) %>% 
    scale_nominal("y", padding = 0) %>% 
    scale_numeric("fill", range=c("lightgreen", "darkgreen")) %>% 
    add_legend("fill", title = "CUSTOM LEGEND") %>% 
    add_axis("x", title = "A") %>% 
    add_axis("y", title = "B")

enter image description here

источник

2015-03-10 00:29:00

Как создать простую карту тепла в R

ответ

Смежные вопросы