У меня есть кадр данных, который выглядит следующим образом (реальные из них имеет 7000 + строк и 17 столбцов):Спирмена - попарно корреляции
V1 V2 V3 V4
1 93 98 79 170
2 17 17 22 85
3 1 57 137 320
4 9 1 0 440
5 NA NA NA 22
Я хотел бы сделать попарные корреляции Спирмена для каждой колонки, и экстракт оценки коэффициентов корреляции для каждого попарного сравнения.
Я попробовал функцию ткор, но выход только NA:
rcor.test(data.matrix(data), method = "spearman")
V1 V2 V3 V4
V1 ****** NA NA NA
V2 <0.001 ***** NA NA
V3 <0.001 <0.001 ***** NA
V3 <0.001 <0.001 <0.001 *****
Я не уверен, что я делаю неправильно, я пытался использовать кадр данных в виде матрицы, но не повезло
Есть идеи?
Какие классы данных, Э.И. 'sapply (data, class)' дает вам? С вашим примером 'rcor.test (data, method =" spearman ")' работает отлично. Хотя верхний треугольник, который должен быть «NA», и нижний треугольник может быть действительным, если у вас очень низкая корреляция. В любом случае, если у вас есть классы «factor», 'data.matrix' будет их неправильно преобразовывать –
Все классы являются числовыми – user3188922
Если я использую простой cor.test для двух столбцов, он отлично работает – user3188922