Создание большой матрицы в R

Question

Как создать большую матрицу в R или как можно закрепить большую матрицу на какой-нибудь объект?

y <- matrix(rnorm(2e4*2e4),1:20000,1:20000) 
Error: cannot allocate vector of size "..." Gb 

Как можно выделить эту матрицу?

Answer 1

Я являюсь огромным поклонником пакета big.memory, и я являюсь пользователем Windows. Чтобы использовать пакет, я сначала решил остаться с R 2.15, так как он по-прежнему имеет функциональную версию Windows big.memory, доступную на CRAN. Для R 3.0 мне пришлось скомпилировать эту старую версию для работы с моими большими матрицами.

Answer 2

Я не знаю, почему я даю это серьезный ответ, но здесь идет ...

1.I может установить bigmemory просто отлично. Возможно, если у вас возникли проблемы, вы должны поделиться сообщением об ошибке, вашей средой и ОС, а затем попросить об этом помощь.

2.Perhaps это просто пример:

y <- outer(1:20000,1:20000) 
    Error: cannot allocate vector of size "..." Gb 

но вы действительно хотите сделать это? Не могли бы вы реорганизовать свой код, чтобы многократно повторять или перепрограммировать меньшую матрицу или читать данные по одному за раз ...

3.Считаете ли вы использование RSQlite? Он очень прост в установке, и особенно сейчас пакет dplyr очень удобен для пользователя.