Я пытаюсь прочитать файл MatLab с помощью следующего кодачтения v файл 7,3 мата в питоне
import scipy.io
mat = scipy.io.loadmat('test.mat')
, и это дает мне следующую ошибку
raise NotImplementedError('Please use HDF reader for matlab v7.3 files')
NotImplementedError: Please use HDF reader for matlab v7.3 files
так может кто-нибудь пожалуйста, имел то же самое проблема и может угодить любой образец кода
благодаря
Попробуйте использовать h5py модуль
import h5py
with h5py.File('test.mat', 'r') as f:
f.keys()
да, но есть массив структур, и я понятия не имею, как читать его, – Shan
' f.keys() 'должен указывать имена переменных, хранящихся в' 'test.mat''. Можете ли вы получить доступ к 'f ['s'] [0] .keys()'? Предполагая, что '' 'является именем массива struct, который вы сохранили, это должно дать вам список полей' s'. – Shai
Нет, я не могу его получить, более конкретно, я пытаюсь прочитать файл мата, указанный на следующем веб-сайте, http://ufldl.stanford.edu/housenumbers/, в файле train.tar.gz, есть коврик файл с именем digitStruct.mat – Shan
В соответствии с кулинарной книгой Scipy. http://wiki.scipy.org/Cookbook/Reading_mat_files,
Начиная с версии 7.3 Matlab, файлы матов фактически сохраняются с использованием формата HDF5 по умолчанию (за исключением случаев использования флага -vX во время экономии, см. Справку по спасению в Matlab). Эти файлы можно прочитать в Python, используя, например, PyTables или h5py-пакет. Чтение структур Matlab в файлах матов в данный момент не поддерживается.
Возможно, вы могли бы использовать Octave для повторного сохранения с использованием флага -vX.
Насколько я могу судить, октава не поддерживает файлы v7.3. Так что вам действительно нужно переустановить, используя достаточно недавнюю версию matlab. –
import h5py
import numpy as np
filepath = '/path/to/data.mat'
arrays = {}
f = h5py.File(filepath)
for k, v in f.items():
arrays[k] = np.array(v)
вы должны закончить с вашими данными в arrays Словаре, если у вас есть MATLAB структуры, я подозреваю. Надеюсь, поможет!
, похоже, не работает для меня .. –
Какую проблему вы наблюдаете? вы проверили, что MATLAB (или октава) может открыть файл? – norok2
Да, я могу открыть его с ними! –
Я взглянул на эту проблему: https://github.com/h5py/h5py/issues/726. Если вы сохранили файл с ковриком -v7.3 варианта, вы должны создать список ключей с (под Python 3.x):
import h5py
with h5py.File('test.mat', 'r') as file:
print(list(file.keys()))
Для того, чтобы получить доступ к переменным a к примеру, вы должны использовать тот же трюк :
with h5py.File('test.mat', 'r') as file:
a = list(file['a'])
Мне это нравится. Он отлично работает! –
Per Magu_'s answer on a related thread, проверить пакет hdf5storage, который имеет удобные функции для чтения v7.3 MATLAB матовых файлов; это так же просто, как
import hdf5storage
mat = hdf5storage.loadmat('test.mat')
, связанные с: http://stackoverflow.com/q/874461/1714410 – Shai