ruby ​​gnuplot heatmap для самоорганизующихся выходов карты

Question

Я делаю некоторые эксперименты на SOM в рубине. После получения лучшей единицы соответствия мой вывод выглядит следующим образом: координата x, координата y и расстояние от лучшего совпадения

У меня есть 200 строк.

Я хочу сделать тепловую карту для этого выхода, но попадаю в проблемы с gnuplot.

кода я использую:

Gnuplot.open do |gp| 
    Gnuplot::Plot.new(gp) do |plot| 
    plot.title "heatmap" 
    plot.xlabel "x" 
    plot.ylabel "y" 
    plot.xrange "[0:50]"   
    plot.yrange "[0:50]"   
    plot.terminal "png" 
    plot.output "myheatmap.png" 
    plot.set "pm3d map" 
    plot.set "palette rgbformula -7,2,-7" # for green heatmap 
    plot.set "autoscale fix"  
    plot.cbrange "[0.0:0.036]" # range of distance 
    plot.cblabel "Score"  
    plot.unset "cbtics" 
    plot.data << Gnuplot::DataSet.new([x,y,dist]) do |ds| 
     ds.with = "image" 
     ds.notitle 
    end 
    end 
end 

х и у массив содержит целое число (для координат) и расстояние массива содержит значение с плавающей запятой.

Я уже искал здесь и на сайте gnuplot. Зеленого цвета, используемый вдохновлено здесь: Gnuplot: how to write the z values in a heatmap plot

успеха я в черчении расстояния с точками, но мне нужно больше визуального сюжет с тепловой картой.

Помощь будет оценить благодаря

редактировать: Привет Christoph, мои данные выглядит как несколько строк ниже:

24,15,1.1214532012163798e-13, 
41,41,2.088613932696844e-13, 
4,10,1.485599551044706e-13, 
0,20,7.981851602311569e-14, 
6,46,1.1231898879790176e-13, 
8,24,1.2844471889344152e-13, 
11,24,2.3794505905958835e-13, 
3,16,0.015633285670666745, 
3,46,1.238425800407315e-13, 
4,20,1.2695729760609708e-13, 

Я отображающих каждый столбец в соответствующий тип (INT для первого два и поплавок для последнего). x и y представляют координаты узла, а последний столбец представляет собой расстояние между входом и единицю наилучшего соответствия. Я хочу построить карту тепла (50x50) и раскрасить каждый узел в зависимости от расстояния (белый на короткое расстояние, зеленый темнее для самого большого расстояния).

Основная проблема заключается в том, что я не успел построить то, что я хочу, с помощью кода, вставленного ниже. Я предполагаю, что я не могу вставить снимок экрана, так как я не достаточно пост ..

редактировать 2: Я также стараюсь круглой колонны расстояние, не изменяется

редактировать 3: Я, наконец, превратить свой выход (3 вектора: x, y, расстояние) в регулярную сетку.

Я создал двумерный массив, заполненный 1,0:

ntab = Array.new(50) { |i| Array.new(50) { |i| 1.0 }} 

то я смотрю на соответствующий индекс по х и у векторов, что указывает узел присутствует в моих векторов, и заполнить ntab узел с соответствующим значением расстояния:

(1..50).each do |xv| 
    (1..50).each do |yv| 
    resx = x.each_with_index.select { |x, idx| x == xv} 
    resy = y.each_with_index.select { |y, idy| y == yv} 
    resx.each do |row| 
     next if row.empty? 
     tmp = [yv,row[1]] 
     if resy.include?(tmp) 
     then 
     ntab[xv-1][yv-1] = dist[row[1]] 
     end 
    end 
    end 
end 

У меня теперь идеальная сетка (50x50), из которой я могу построить значение расстояния.Я буду редактировать свой вопрос с готовым рабочим кодом, если я нахожу :)

Спасибо Кристофа за советы о Gnuplot

Answer 1

В результате я, наконец, не совсем то, что я хочу, но это сделать трюк для анализа кластеров SOM

массив узел заполнения с максимальным значением расстояния, а затем построить на код ниже (я не ставил ссылку, потому что мне нужно также 10 репутации точек на публикацию более 2 ссылки: /)

Gnuplot.open do |gp| 
    Gnuplot::SPlot.new(gp) do |plot| 
    plot.pm3d 
    plot.hidden3d 
    plot.palette 'defined ( 0 "black", 51 "blue", 102 "green", 153 "yellow", 204 "red", 255 "white")' 
    plot.data << Gnuplot::DataSet.new(ntab) do |ds| 
     ds.with = 'lines' 
     ds.matrix = true 
    end 
    end 
end