R, ggplot - Плотность показывает пробелы

Question

Я столкнулся с какой-то ошибкой при попытке построить участок плотности 2d, используя функцию ggplot2 stat_density2d. Когда я только пытаюсь построить контуры для графа, кажется, работает нормально:

ggplot(mydata, aes(x=x_loc, y=y_loc)) + stat_density2d(aes(fill = ..level..)) 

Однако, когда я пытаюсь заполнить слои с помощью геого = «многоугольника»

ggplot(mydata, aes(x=x_loc, y=y_loc))+stat_density2d(aes(fill = ..level..), geom = "polygon") 

я получаю это:

Это выглядит как он дает ошибку геометрии по какой-то причине, но я не знаю, почему. Я попытался обойти это, но я не могу найти решение. Я обновил мою версию R и все мои пакеты, но это не исправляет.

Как воспроизводимым например:

matrix = matrix(c(1,1,1,2,2,2,3,3,3,4,4,4,5,5,5,6,6,6,1,2,3,1,2,3,1,2,3,1,2, 
3,1,2,3,1,2,3,18,12,20,24,22,35,18,12,19,20,5,16,11,7,10,5,1,3), nrow = 18) 

ggplot(as.data.frame(matrix), aes(x=V1, y=V2)) + 
stat_density2d(aes(fill = ..level..), geom = "polygon") 

который имеет аналогичные проблемы, например, по бокам и сверху и снизу:

Если кто-то может помочь мне с этим это было бы здорово, застряли в этом несколько часов.

Заранее благодарен!

Answer 1

Как упоминалось в комментарии @ joran, this question, похоже, похож на аналогичный. По умолчанию значения клиппинга вызывают проблему. Следующие работы для меня:

library(ggplot2) 

matrix = matrix(c(1,1,1,2,2,2,3,3,3,4,4,4,5,5,5,6,6,6,1,2,3,1,2,3,1,2,3,1,2, 
3,1,2,3,1,2,3,18,12,20,24,22,35,18,12,19,20,5,16,11,7,10,5,1,3), nrow = 18) 

ggplot(as.data.frame(matrix), aes(x=V1, y=V2)) + 
stat_density2d(aes(fill = ..level..), geom = "polygon")+ 
lims(x = c(-1,8),y = c(-.25,4.25))