разделить большой файл, добавить первую строку в качестве имени файла

Question

У меня есть большой файл, приведенный ниже. Я хотел бы разделить его на несколько файлов, первая строка - имя файла примера «FP3SLUG00012600.txt»

Я могу разбить его на несколько запусков на «>», но не в состоянии назвать первую строку как имя файла ,

в файле:

 
>FP3SLUG00012600 
ACCCTCCACGACACTCCTCAAGATCTCACCAAAATGCCCGGCAAGGTCAAGGCGTATGAG 
>FP3SLUG00012602 
ACCCTCCACGACACTCCTCAAGATCTCACCAAAATGCCCGGCAAGGTCAAGGCGTATGAG 
>FP3SLUG00012603 
ACCCTCCACGACACTCCTCAAGATCTCACCAAAATGCCCGGCAAGGTCAAGGCGTATGAG 
>FP3SLUG00012604 
ACCCTCCACGACACTCCTCAAGATCTCACCAAAATGCCCGGCAAGGTCAAGGCGTATGAG 

выходного файла, необходимого с содержанием в нем

file1: FP3SLUG00012604.txt

 
>FP3SLUG00012604 
ACCCTCCACGACACTCCTCAAGATCTCACCAAAATGCCCGGCAAGGTCAAGGCGTATGAG 

file2: FP3SLUG00012603.txt

 
>FP3SLUG00012603 
ACCCTCCACGACACTCCTCAAGATCTCACCAAAATGCCCGGCAAGGTCAAGGCGTATGAG 

Answer 1

You можно попробовать awk для расколоть multifasta файла

awk '/^>/{filename=substr($1,2) ".txt"}{print > filename}' file.fasta 

Вы получаете несколько файлов с последовательностью в формате FASTA