Разбор строки с разделителем в Python

Question

У меня есть строки данных, которые я хочу проанализировать. данные выглядит следующим образом:

a score=216 expect=1.05e-06 
a score=180 expect=0.0394 

То, что я хочу сделать, это иметь подпрограмму , анализирующие их и возвращает 2 значения (оценка и ожидать) для каждой строки.

Однако эта функция шахты, кажется, не работает:

def scoreEvalFromMaf(mafLines): 
    for word in mafLines[0]: 
     if word.startswith("score="): 
      theScore = word.split('=')[1] 
      theEval = word.split('=')[2] 
      return [theScore, theEval] 
    raise Exception("encountered an alignment without a score") 

Пожалуйста, советы, что это правильный способ сделать это?

Answer 1

Похоже, вы хотите разделить каждую строку на пробелы и разобрать каждый фрагмент отдельно. Если mafLines является строкой (т.е. одна строка из .readlines():..

def scoreEvalFromMafLine(mafLine): 
    theScore, theEval = None, None 
    for word in mafLine.split(): 
     if word.startswith("score="): 
      theScore = word.split('=')[1] 
     if word.startswith("expect="): 
      theEval = word.split('=')[1] 

    if theScore is None or theEval is None: 
     raise Exception("Invalid line: '%s'" % line) 

    return (theScore, theEval) 

, как вы делали это будет перебирать каждый символ в первой строке (так как это список строк), а не на каждом пространстве

Answer 2

Если mafLines, если список строк, и вы хотите посмотреть только на первый, .split, что линия, чтобы получить слова. Например:

def scoreEvalFromMaf(mafLines): 
    theScore = None 
    theEval = None 
    for word in mafLines[0].split: 
     if word.startswith('score='): 
      _, theScore = word.partition('=') 
     elif word.startswith('expect='): 
      _, theEval = word.partition('=') 
    if theScore is None: 
     raise Exception("encountered an alignment without a score") 
    if theEVal is None: 
     raise Exception("encountered an alignment without an eval") 
    return theScore, theEval 

Обратите внимание, что это будет возвращать кортеж с двумя строки пунктов; если вы хотите Int и поплавок, например, вам нужно изменить последнюю строку на

return int(theScore), float(theEval) 

и тогда вы получите исключение ValueError если либо строка является недействительной для типа он должен представлять, и возвращенный кортеж с двумя номерами, если обе строки действительны.

Answer 3

обязательное и, возможно, неуместны регулярное_выражение решение:

import re 
def scoreEvalFromMaf(mafLines): 
    return [re.search(r'score=(.+) expect=(.+)', line).groups() 
      for line in mafLines]