В настоящее время я пытаюсь запустить некоторый R-код на вычислительном кластере, но не могу запустить функцию install.packages из-за некоторых странных настроек брандмауэра в моем кластере. Поскольку я использую только несколько пакетов в своем R-коде, я надеялся избежать использования функции install.packages, загрузив и установив пакеты вручную.Ручная загрузка и установка пакетов в R
Примечание: Я знаю, что есть способ избежать этой проблемы, используя HTTP-прокси, как описано в FAQ R. К сожалению, люди, отвечающие за мой кластер, не помогают в настройке, поэтому я вынужден рассмотреть этот альтернативный подход.
В идеале я хотел бы загрузить файлы пакетов из CRAN на свой компьютер, затем загрузить эти файлы в кластер и установить их с помощью соответствующих команд в R. Кроме того, я также хотел бы убедиться, что пакеты устанавливаются в выбранное мной место, так как у меня нет разрешения «писать» в каталоге по умолчанию R (я считаю, что могу сделать это в R с помощью функции .libPaths)
Наконец, компьютеры, на которых я Я работаю в кластере Unix x86_64.
Это, безусловно, возможно сделать, и функция' install.packages' примет аргумент репозитория NULL. –
Удивительный! Я этого не понимал. Просто чтобы подтвердить, что следующий фрагмент должен работать, исправить? 'install.packages (pkgs = MyListofTARGZFiles, repos = NULL, lib = MyLibraryDirectory)' –
Не уверен, что именно формализм будет работать, если предположить, что это действительно список. Первый аргумент должен быть символьным вектором. –