Приносим извинения за простоту этой проблемы.Невозможно правильно ввести аргументы для java-файла
Я пытаюсь использовать программу ChromHMM для анализа некоторых биологических данных. Я пытаюсь запустить программу в соответствии с инструкциями, но не могу правильно ввести аргументы.
Вот пример: Е: \ ComputationalAnalysis \ ChromHMM> Java -mx1600M -jar ChromHMM.jar BinarizeBed
chromosomelengthfile = \ CHROMSIZES \ hg19.txt inputbeddir = \ Donor1 cellmarkfileta BLE = \ Donor1 \ cellmarkfile.txt outputbinarydir = \ firstoutput
возвращает только это: использования BinarizeBed [-b binsize] [- с controldir] [- центр] [- colfields хромосомы, STA Р.Т., конец [, прядь]] [- е offsetend] [-f foldthresh] [- n shift] [- o outputcontroldir] [- p poissonthresh] [- peaks] [- s offsetstart] [- strictthresh] [- t outputignaldir] [- u pse udocountcontrol] [- w flankwidthcontrol] chromosomelengthfile inputbeddir cellmark filetable outputbinarydir
В руководстве сказано, что 4 аргумента в конце являются единственными, которые нужно запустить. Кто-нибудь знает, что я делаю неправильно? Я пытаюсь сделать это из командной строки Windows
О, спасибо так много, что работал. Кроме того, мне пришлось изменить все каталоги на полный путь. Итак, для первого e: \ computationalanalysis \ chromhmm \ chromsizes \ hg19.txt для первого аргумента. Знаете ли вы, есть ли учебник в любом месте, который научит меня, как правильно это делать? У меня было много проблем с поиском чего-либо, но я просто не могу использовать правильный словарь – Copacetik
, если вам не нужен полный каталог, если вы удалите главную косую черту. поэтому измените его на CHROMSIZES \ hg19.txt –
вот основные команды командной строки. Я не уверен, если это поможет многим http://www.computerhope.com/issues/chusedos.htm –