Как сгенерировать помеченную дендрограмму с помощью agnes?

Question

Используя код из: http://en.wikibooks.org/wiki/Data_Mining_Algorithms_In_R/Clustering/Hierarchical_Clustering

Вот как генерировать dendogram:

# import data 
x <- read.table("data.txt") 

# run AGNES 
ag <- agnes (x, false, metric="euclidean", false, method ="single") 

# print components of ag 
print(ag) 

# plot clusters 
plot(ag, ask = FALSE, which.plots = NULL) 

Я получаю ошибку на

ag <- agnes (x, false, metric="euclidean", false, method ="single") 

Погрешность составляет:

Error in agnes(x, false, metric = "euclidean", false, method = "single") : 
    object 'false' not found 

Эта реализация agnes работает, но ее генерация пронумерованные этикетки для dendogram:

ag <- agnes (data, metric="euclidean") 
# plot clusters 
plot(ag, ask = FALSE, which.plots = NULL) 

dendogram:

dendogram генерируется из http://en.wikibooks.org/wiki/Data_Mining_Algorithms_In_R/Clustering/Hierarchical_Clustering включает в себя метки:

Вот файл данных:

,ba,fi,mi,vo,rm,to 
ba,0,662,877,255,412,996 
fi,662,0,295,468,268,400 
mi,877,295,0,754,564,138 
vo,255,468,754,0,219,869 
rm,412,268,564,219,0,669 
to,996,400,138,869,669,0 

Как можно сгенерировать помеченный иерархический кластер на основе вышеуказанных данных, который аналогичен помеченной дендрограмме выше?

Обновление:

После выполнения @sgibb предложение я использовал это:

ag <- agnes(data, FALSE, metric="euclidean", FALSE, method ="single") 

# plot clusters 
plot(ag, ask = FALSE, which.plots = NULL) 

dendogram генерируется теперь:

Это неправильное строение. Может быть, это указывает на то, что имена столбцов моего набора данных выглядят как 1,2,3,4,5,6 и не помечены, если да, то как я могу изменить оператор импорта?

набор данных импортирован:

Answer 1

Моя проблема была лишняя запятая в наборе данных.

running help(read.table) и принимая во внимание этого раздела помогло мне решить эту проблему:

If there is a header and the first row contains one fewer field than the number of columns, the first column in the input is used for the row names. Otherwise if row.names is missing, the rows are numbered. 

Это работает:

1. импорт данных Vai т-Gui данных для импорта:

   ba, fi, mi, vo, rm, до ba, 0,662,877,255,412,996 fi, 662,0,295,468,268,400 ми, 877,295,0,754,564,138 В.О., 255,468,754,0,219,869 гт, 412,268,564,219,0,669 к, 996,400,138,869,669,0

2. выполнить команды:

< AG - Агнес (данные, FALSE, метрические = "евклидово", значение FALSE, метод = "одиночный")

участка (аги, задать = FALSE, то which.plots = NULL)

Это создает этот dendogram, который л OKS корректные: