Ваше предположение о неправильной структуре maven по умолчанию src/target/pom.xml
.
Структура папки по умолчанию: четыре ваших исходных файла: src/main/java
, а для файлов ресурсов - src/main/resources
. Если у вас есть статическое содержимое, такое как html и javascript файлы, они идут в папку src/main/webapp
.
См. Это link для более подробной информации.
Ваша IDE (будь то Eclipse или Netbeans) имеет (и не должна) NO Управление структурой папки при импорте/создании проекта maven в среде IDE. Скорее он контролируется Maven.
IDE будет просто отображать структуру папок, как она есть в настоящее время.
Реорганизуйте структуру папок на основе ссылки, которую я дал выше, и вы должны быть добры, если хотите.