2014-11-16 3 views
0

Привет, все У меня есть кадр данных с 5 образцами A, B, C, D, E. и то, что я хочу сделать, это, во-первых, поиск mirna, который в целом сильно коррелирован с miRNA с отсутствующим значением и принимает значение, полученное из этой Mirna .. напримерРепликация NA с коррелированными значениями в строках

miRNA-1 значения: 1 2 3 NA 5 микроРНК 2-значения: 2 4 6 8 10 ==> заменить недостающее значение, полученное из второго микроРНК на 4.

Это то, что я хочу сделать для моего кадра данных в R

Любая помощь было бы действительно оценено :)

          A  B   C   D 
hsa-miR-199a-3p, hsa-miR-199b-3p   NA 13.13892 5.533703 25.67405 
hsa-miR-365a-3p, hsa-miR-365b-3p  15.70536 52.86558 18.467540 223.51424 
hsa-miR-3689a-5p, hsa-miR-3689b-5p  NA 21.41597 5.964772  NA 
hsa-miR-3689b-3p, hsa-miR-3689c  9.58696 44.56490 10.102051 13.26785 
hsa-miR-4520a-5p, hsa-miR-4520b-5p 18.06865 28.06991  NA  NA 
hsa-miR-516b-3p, hsa-miR-516a-3p   NA 10.77471 8.039662  NA 
              E  
hsa-miR-199a-3p, hsa-miR-199b-3p   NA 
hsa-miR-365a-3p, hsa-miR-365b-3p 31.93503 
hsa-miR-3689a-5p, hsa-miR-3689b-5p 24.26073 
hsa-miR-3689b-3p, hsa-miR-3689c   NA 
hsa-miR-4520a-5p, hsa-miR-4520b-5p  NA 
hsa-miR-516b-3p, hsa-miR-516a-3p   NA 

ответ

0

У вас был взгляд на этот ответ (esp Akrun's short cut from zoo)? Я ценю, что это не совсем то, что вы хотите, но может дать некоторые выводы. Это для средних соседей, поэтому предположим, что 1 2 3 NA 5 будет 4 (в среднем 3 и 5).

Replacing NA's in R numeric vectors with values calculated from neighbours

Попытка найти корреляцию между парами с помощью всего 4 точек данных, как один отсутствует, является непростой задачей.

Смежные вопросы