Мои подозрения в том, что вы не перенести проект из затмения правильно.
Перенастройка из Затмения
Если вы ранее разработанные для Android с помощью Eclipse, и хотели бы перейти на Android Studio, вы должны экспортировать проекты из Eclipse, для того, чтобы генерировать Gradle файлы сборки. Затем вы можете импортировать свой проект в Android Studio.
Экспорт из Затмения
Обновите Затмение ADT Plugin (вы должны иметь версию 22.0 или выше). В Eclipse выберите «Файл»> «Экспорт». В появившемся окне откройте Android и выберите «Сгенерировать файлы сборки Gradle». Выберите проект, который вы хотите экспортировать для Android Studio, и нажмите «Готово».
Ваш выбранный проект остается в том же месте, но теперь содержит файл build.gradle и готов для Android Studio.
Импорт в Android Studio
В Android Studio, закройте все проекты в настоящее время открыт. Вы должны увидеть окно Welcome to Android Studio. Нажмите «Импортировать проект». Найдите проект, который вы экспортировали из Eclipse, разверните его, выберите файл build.gradle и нажмите «ОК». В следующем диалоговом окне оставьте флажок Использовать оболочку градиента и нажмите «ОК». (Вам не нужно указывать дом Gradle.)
Примечание. Можно импортировать существующий Android-проект в Android Studio, даже если вы не создаете файл сборки Gradle из Eclipse-Android Studio, который будет успешно создавать и запускать проектов с использованием существующего файла сборки Ant. Однако, чтобы в будущем использовать преимущества вариантов сборки и других дополнительных функций, мы настоятельно рекомендуем создать файл сборки Gradle с использованием плагина ADT или написать собственный файл сборки Gradle для использования с Android Studio.
source
Как выглядит ваш каталог проектов? Если ваш проект называется XXXX, все java-файлы находятся внутри XXXXProject/XXXX/src, правильно? Вы ищете в XXXX/или XXXXProject /? – alikonda