Числовая колонка в цитоискателе

Question

Я новичок в cytoscape. Я хочу сделать ширину ребер в моей сети в соответствии с определенным числом.

мой файл выглядит следующим образом:

node1 node2 34,04
node3 node2 56,89
node4 node5 8,09
node1 node4 10,54

когда я импортировать мой файл сети я выбираю столбец 3, чтобы быть " взаимодействия». Затем число в столбце 3 заканчивается в столбце строки и не может использоваться для непрерывного отображения. Когда я импортирую ту же таблицу, что и атрибуты узла, я все еще могу получить ее в столбце строки.

Я попытался посмотреть в руководстве и многоголосый, но, похоже, я единственный, у кого есть эта проблема. Как это решить? Спасибо

Answer 1

Этот ответ предназначен для Cytoscape 2.8.3. Вероятно, это относится к 3.?.?.

Как вы говорите, с вашим файловым номером цифры будут использоваться для популяционного «взаимодействия», и это атрибут String.

Итак, для вашего файла не устанавливайте тип взаимодействия (красный) в диалоговом окне «Импорт сети из таблицы». Вместо этого установите исходное взаимодействие (фиолетовый) в колонку 1 и целевое взаимодействие (оранжевое) в столбце 2. Затем в таблице внизу диалогового окна щелкните заголовок столбца Столбец 3. Он станет синим. Затем он будет импортирован как атрибут с плавающей запятой как «Столбец 3», и вы можете использовать его в Continuous mapper.