Фрагментация на дисковых системах важна, потому что голова физически должна перемещаться в каждое место, чтобы ее прочитать. Кэш APC, хотя по определению, находится в памяти произвольного доступа, поэтому штраф за то, что он должен читать другое место, находится в порядке нескольких циклов процессора, т.е. незначительно, если вы серьезно не загружаете CPU. И если вы это делаете, у вас возникают большие проблемы.
Также не назначайте APC слишком много ОЗУ. Вы действительно хотите на 5-10% больше максимально возможного кеша. Более того, это трата драгоценного ОЗУ.
Я думаю, что вводить фрагментацию как метрику на страницу монитора APC, вводить в заблуждение, так как это не так важно, и люди слишком беспокоятся о ней. Работа с сильно фрагментированным APC на порядок лучше, чем без него.