По данным сайта вы создали галерею как
<div id="gallery">
<a href="path/to/image1.jpg"><img src="path/to/image1_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image2.jpg"><img src="path/to/image2_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image3.jpg"><img src="path/to/image3_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image4.jpg"><img src="path/to/image4_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image5.jpg"><img src="path/to/image5_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image6.jpg"><img src="path/to/image6_thumbnail.jpg" /></a>
</div>
и у вас есть вызов JQuery как
var foo = $('#gallery');
foo.poptrox();
так что вам просто нужно добавить еще одну галерею как
<div id="gallery1">
<a href="path/to/image1.jpg"><img src="path/to/image1_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image2.jpg"><img src="path/to/image2_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image3.jpg"><img src="path/to/image3_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image4.jpg"><img src="path/to/image4_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image5.jpg"><img src="path/to/image5_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image6.jpg"><img src="path/to/image6_thumbnail.jpg" /></a>
</div>
<div id="gallery2">
<a href="path/to/image1.jpg"><img src="path/to/image1_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image2.jpg"><img src="path/to/image2_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image3.jpg"><img src="path/to/image3_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image4.jpg"><img src="path/to/image4_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image5.jpg"><img src="path/to/image5_thumbnail.jpg" /></a>
<a href="path/to/image6.jpg"><img src="path/to/image6_thumbnail.jpg" /></a>
</div>
и добавить еще один jQuery
var foo = $('#gallery1');
foo1.poptrox();
var foo2 = $('#gallery2');
foo1.poptrox();
Я надеюсь, что это помогает, и если вы размещаете вы пробовали, я могу видеть, как лучше помочь
вы можете добавить пример того, что у вас есть? мы хотели бы помочь, но нам нравится знать, что вы сделали – MZaragoza