2
Я пишу работу, которая преобразует ДХМЫ в JPG изображений, используя DICOM каменьLoadError: не может загрузить такой файл - RMagick с DICOM жемчужиной
здесь код
require 'RMagick'
require 'dicom'
include Magick
include DICOM
class DicomtojpgJob < ActiveJob::Base
queue_as :dicom
def perform(*args)
puts "were are here"
dcm_filename = args[0]
dcm = DObject.read(dcm_filename)
puts dcm.summary
dcm_image = dcm.image
name = dcm_filename.split('.')
dcm_image.normalize.write(name[0]+".jpg")
# img = ImageList.new("IM-0004-0044.jpg")
# img.display
# args[0].update_attributes(:asset_path_url)
puts args[0]
exit
end
end
вот что я получаю на консоли
DICOM Object Properties:Byte Order (CPU): Little Endian
-------------------------------------------
Source: File (successfully read): /home/aditya/orthoweb/public/patient-summary-assets/56c6b0b943fe4728c8000007_photo_20160219_122843.dcm
DICOM Object Properties:
Modality: MR Image Storage-------------------------------------------
Source: File (successfully read): /home/aditya/orthoweb/public/patient-summary-assets/56c6b0b943fe4728c8000007_photo_20160219_151307.dcm
Modality: MR Image Storage
Meta Header: Yes
Value Representation: Explicit
Byte Order (File): Little Endian
Pixel Data: Yes
Image Size: 512*288
Number of frames: 1
Meta Header: YesPhotometry: MONOCHROME2
Compression: JPEG 2000 Image Compression
Value Representation: ExplicitBits per Pixel: 16
Byte Order (File): Little Endian-------------------------------------------
Pixel Data: Yes
Source: File (successfully read): /home/aditya/orthoweb/public/patient-summary-assets/56c6b0b943fe4728c8000007_photo_20160219_151307.dcm
Modality: MR Image Storage
Image Size: 512*288Meta Header: Yes
Value Representation: Explicit
Number of frames: 1Byte Order (File): Little Endian
Photometry: MONOCHROME2Pixel Data: Yes
Image Size: 512*288
Number of frames: 1Compression: JPEG 2000 Image Compression
Bits per Pixel: 16Photometry: MONOCHROME2
-------------------------------------------Compression: JPEG 2000 Image Compression
Source: File (successfully read): /home/aditya/orthoweb/public/patient-summary-assets/56c6b0b943fe4728c8000007_photo_20160219_122843.dcmBits per Pixel: 16
Modality: MR Image Storage
Meta Header: Yes
Value Representation: Explicit
Byte Order (File): Little Endian
Pixel Data: Yes
Image Size: 512*288
Number of frames: 1
2016-02-19T10:07:18.291Z 17868 TID-1ho0x0 DicomtojpgJob JID-4fc6a66b41be878a632b7d9e INFO: fail: 0.014 sec
2016-02-19T10:07:18.291Z 17868 TID-1ho0x0 WARN: {"class"=>"ActiveJob::QueueAdapters::SidekiqAdapter::JobWrapper", "wrapped"=>"DicomtojpgJob", "queue"=>"dicom", "args"=>[{"job_class"=>"DicomtojpgJob", "job_id"=>"345b5c25-82fb-49e7-a59d-b4a5eaf971b6", "queue_name"=>"dicom", "arguments"=>["/home/aditya/orthoweb/public/patient-summary-assets/56c6b0b943fe4728c8000007_photo_20160219_151307.dcm"]}], "retry"=>true, "jid"=>"4fc6a66b41be878a632b7d9e", "created_at"=>1455874987.2288666, "enqueued_at"=>1455876438.270517, "error_message"=>"cannot load such file -- rmagick", "error_class"=>"LoadError", "failed_at"=>1455874987.2376463, "retry_count"=>6, "retried_at"=>1455876438.2907836}
Photometry: MONOCHROME2
Compression: JPEG 2000 Image Compression
Bits per Pixel: 162016-02-19T10:07:18.291Z 17868 TID-1ho0x0 WARN: LoadError: cannot load such file -- rmagick
Я последовал за эту проблему на странице GitHub here Он предположил, что если я могу преобразовать изображение в ДХМАХ JPG непосредственно с помощью комм и convert -debug module IM-0001-0001.dcm IM.jpg, тогда dicom не должен показывать никаких ошибок. я могу конвертировать его в JPG с помощью консоли, но DICOM бросает error 2016-02-19T09:24:03.960Z 14165 TID-1kcakw WARN: LoadError: cannot load such file -- rmagick
Как я могу это исправить
У вас установлен делегат JPEG2000? Можете ли вы поделиться изображением DICOM для тестирования? –
перейдите по этому адресу http://www.osirix-viewer.com/datasets/ и загрузите первую почтовую папку – Supertracer
@Mark Setchell, как я могу проверить, что у меня установлен делегат JPEG2000? – Supertracer