Понимание ошибки маршрутизации (Python)

Question

Я пытаюсь выполнить работу с программой, которая вызывает файлы в определенной папке. Однако по какой-то причине я все время получаю сообщение об ошибке. Я опубликую соответствующий код и сообщение об ошибке.

Код:

def objmask(inimgs, inwhts, thresh1='20.0', thresh2='2.0', tfdel=True, 
      xceng=3001., yceng=3001., outdir='.', tmpdir='tmp'): 
# initial detection of main galaxy with SExtractor for re-centering purposes 
    if outdir!='.': 
     if not os.path.exists(outdir): 
      os.makedirs(outdir) 

    if not os.path.exists(tmpdir): 
     os.makedirs(tmpdir) 
    for c in range(np.size(inimgs)): 
     print 'Creating Aperture Run:', c 
     subprocess.call(['sex',inimgs[c],'-c','/home/vidur/se_files/gccg.sex', 
         '-CATALOG_NAME','/home/vidur/se_files/_tmp_seobj'+str(c)+'.cat', 
         '-PARAMETERS_NAME','/home/vidur/se_files/gccg_ell.param', 
         '-FILTER_NAME','/home/vidur/se_files/gccg.conv', 
         '-STARNNW_NAME','/home/vidur/se_files/gccg.nnw', 
         '-CHECKIMAGE_TYPE','APERTURES', 
         '-VERBOSE_TYPE','QUIET', 
         '-DETECT_THRESH',thresh1, 
         '-ANALYSIS_THRESH',thresh2, 
         '-WEIGHT_IMAGE',inwhts[c]],shell=True 
         ) 

Ошибка:

Creating Aperture Run: 0 
Traceback (most recent call last): 
    File "<stdin>", line 1, in <module> 
    File "fetch_swarp2.py", line 110, in objmask 
    '-WEIGHT_IMAGE',inwhts[c]], 
    File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 493, in call 
    return Popen(*popenargs, **kwargs).wait() 
    File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 679, in __init__ 
    errread, errwrite) 
    File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 1249, in _execute_child 
    raise child_exception 
OSError: [Errno 2] No such file or directory 

У меня есть папка с именем se_files в моем домашнем каталоге. Его путь:/home/username/se_files. Это на Ubuntu, 12.04 32-бит.

Answer 1

Проблема в том, что subprocess не может sex, по-видимому, потому, что это не ваша ПУТЬ.

Функция call никогда не будет поднимать исключение, потому что программа, с которой она запускалась, возвращалась с ошибкой; он просто возвращает эту неудачу вам как число. Это только повышает его, он не может запустить программу в первую очередь.

Вы можете увидеть разницу довольно легко:

>>> import subprocess 
>>> subprocess.call(['nosuchprogram']) 
[long traceback skipped] 
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'nosuchprogram' 
>>> subprocess.call(['ls', 'nosuchfile']) 
ls: nosuchfile: No such file or directory 
1 

Первый поднимает; второй возвращает 1.

Таким образом, поставить абсолютный путь к sex в вызове, или убедитесь, что он правильно установлен, или убедитесь, что ваш скрипт работает с правом окружающей среды (например, может быть, вы добавили /opt/sex/bin к вашему PATH только в интерактивных сценариев, или вы добавили его только для своего собственного пользователя, но вы пытаетесь запустить скрипт как nobody или ...).