Синтаксис для отправки задания qsub без фактического файла задания?

Question

Я хотел бы отправить задания qsub на лету без создания дискретных файлов заданий. Итак, скажем, у меня есть скрипт python под названием «get_time.py», который просто сообщает время. Вместо того, чтобы сценарий представления, как это:

cat>job.sub<<eof 
    #PBS -l walltime=1:00:00 
    cd $PBS_O_WORKDIR 
    get_time.py 
eof 

... и затем посылающий задание: qsub job.sub

Я хотел бы иметь возможность обойти шаг создания файла, и я бы изображение конструкт было бы что-то вроде этого: qsub -d . -e get_time.py

где -e мой воображаемый параметр, который говорит, что qsub следующий код, который будет отправлено в планировщик, вместо того чтобы использовать дискретный файл представления.

Я сошел с ума? Похоже, что для этого уже должно быть простое решение, но я не мог найти его нигде. Спасибо за любые предложения!

Answer 1

Вы можете передать имя любого исполняемого скрипта/файла по номеру qsub после того, как вы предоставили все свои варианты (-d . и т. Д.). Любые аргументы, которые появляются после имени сценария, рассматриваются как аргументы для этого скрипта. Например, если бы я имел test.py сценарий:

#!/usr/bin/python 
from sys import argv 
script, param = argv 
print param 

Тогда я могу запустить

qsub test.py 2 

и выход в мой журнал будет 2.

Две важные вещи, чтобы отметить:

1. Ваш скрипт Python должен быть исполняемым (например chmod +x test.py).
2. Ваш сценарий Python должен иметь shebang (например, #!/usr/bin/python).

Answer 2

условии get_time.py является исполняемым, а притон правильно, вы должны быть в состоянии просто запустить

qsub -d . get_time.py 

Если это не по любой причине, вы можете использовать следующие построения

qsub -d . <<< "python get_time.py" 

Answer 3

Я не понимаю вопроса, но ...

echo 'date' | qsub 

не работает хорошо для вас?

Answer 4

Если вы хорошо с написанием вашей работы в ТУТ документе, как в вашем примере, вы можете передать, что здесь документ непосредственно qsub без временного файла:

qsub <<eof 
    #PBS -l walltime=1:00:00 
    cd \$PBS_O_WORKDIR 
    get_time.py 
eof 

отметить также, что вам нужно бежать знак доллара в $PBS_O_WORKDIR, иначе он будет интерполирован перед отправкой задания и заканчивается как пустая строка.

Answer 5

В сетке двигателя, -b у определяет, что вещь должна быть выполнена двоичная, а не сценарий:

qsub -b y get_time.py