По https://azure.microsoft.com/en-us/documentation/articles/active-directory-appssoaccess-whatis/
Существующее Single Sign-On позволяет Azure AD использовать любой существующий единый вход, который был создан для применения, но позволяет эти приложения, которые будут связаны с Управлением 365 или портами панели доступа Azure AD, а также позволяет получать дополнительную отчетность в Azure AD при запуске приложений.
В принципе, этот вариант предназначен для случаев, когда применение уже установленных для единого входа и предоставляет вам URL специфической для экземпляра приложения, например:
https://mycompany.salesforce.com
Вы хотите затем выберите «Существующий SSO» и укажите его на этот URL.
Это в основном предназначено для удобства пользователей, которые получают доступ к большинству своих приложений через панель доступа или панель запуска приложений Office 365. На самом деле это не связано с самой настройкой, связанной с SSO.