IDE/настройка для разработки пакета с интегрированным кодом на C++

Question

Я пытаюсь получить доступ к C++/Rcpp как расширение для R для тяжелых вычислительных задач. В конечном счете, эти C++-библиотеки должны быть интегрированы в пакет, и поэтому я ищу установку/комбинацию инструментов/IDE, которые мне нужно будет легко работать. Я знаю, что многое зависит от вкуса, но все же было бы неплохо узнать мои варианты перед выбором.

Итак: когда вы разрабатываете пакеты R с C++ libs, с какими настройками вы работаете?

• Вы используете один и тот же редактор/IDE для R и C++ и какой (или какие)?
• Есть ли дополнительные инструменты (кроме Rtools), которые важны для получения?
• Есть ли в настройках общие настройки, которые важны для значительного знания или ускорения процесса?

Извините, если этот вопрос задан раньше. Я нашел список всех редакторов для R, но ничего конкретно не было направлено на разработку пакетов, включая код на C++. Любые подсказки или советы действительно оценены.

Edit: платформа для Windows, но я могу перейти на Linux без проблем (двойная загрузка, единственное, что удерживает меня от использования убунта является отсутствием достойного водителя для моей старой карты/старое сочетание экрана)

Answer 1

Затмение + statet если вы хотите присоединиться к нам в современном мире :)

Answer 2

I «м конечно полностью в пользу более Rcpp работы :)

Что касается ваших вопросов, и в следующем порядке:

• же редактор (Emacs), что делает для хорошей консистенции на любой платформе, я использую (в основном Linux , иногда Windows); для записи я также высказался в пользу qtcreator IDE, которая довольно хороша в Linux и Windows (но не делает R).
• нет, на Linux все это происходит в готовом виде (и да, на Windows, вам нужно Rtools) ...
• не на самом деле - вы, вероятно, уже знаете о inline, который хорош для тестирования R/C++ фрагменты кода.

Edit: Таким образом, в некотором смысле, это на самом деле не отличается от нормального R/C/C++/Fortran развития. И в этом случае я обычно ссылаюсь на R FAQ Section 6, который полностью посвящен R и Emacs :) С учетом сказанного, установка Emacs для работы на C++ не очевидна, и здесь есть несколько вопросов и сообщений. Я не использую браузер определенного класса, но есть некоторые, а также подходы к автозаполнению типов и т. Д.

Answer 3

Вам понадобится редактор, который может обрабатывать несколько языков, R, C +, возможно, Makefile и т. Д. Так как вы упоминаете Rtools, это звучит так, как будто вы на Windows. Я бы предложил Notepad ++ обрабатывать R, C++ и целый ряд других языков. Кроме того, вы можете настроить пользовательскую команду через NppExec для более простого создания пакета. Я разработал несколько пакетов, которые сильно используют C/C++ с помощью Notepad ++.

Answer 4

Я просто написал сценарий CMake для создания проекта Eclipse CDT для разработки пакета Rcpp.

Кроме того, cmake может генерировать CodeBlocks или проекты KDevelop3, но у меня еще нет этих функций.

среда

• CMake> = 2.8.7
• Eclipse,> = 3.7
• Eclipse CDT> = 1.4.2
• R> = 2.15
• Rcpp> = 0,10

Конфигурация

• Скачать FindLibR.cmake из github обеспечивается Rstudio

• Сформировать пакет Rcpp, например

  library(Rcpp) 
  Rcpp.package.skeleton("RcppPackage") 
  

• Поместите следующий скрипт (или загрузить его из gist), названные CMakeLists. txt, в сгенерированной папке , такой как RcppPackage в предыдущем примере.

  cmake_minimum_required(VERSION 2.8) 
  project(RcppPackage) 
  find_package(LibR) 
  if(${LIBR_FOUND}) 
  else() 
      message(FATAL_ERROR "No R...") 
  endif() 
  message(STATUS ${CMAKE_SOURCE_DIR}) 
  execute_process(
      COMMAND ${LIBR_EXECUTABLE} "--slave" "-e" "stopifnot(require('Rcpp'));cat(Rcpp:::Rcpp.system.file('include'))" 
      OUTPUT_VARIABLE LIBRCPP_INCLUDE_DIRS 
  ) 
  include_directories(BEFORE ${LIBR_INCLUDE_DIRS}) 
  message(STATUS ${LIBR_INCLUDE_DIRS}) 
  include_directories(BEFORE ${LIBRCPP_INCLUDE_DIRS}) 
  message(STATUS ${LIBRCPP_INCLUDE_DIRS}) 
  add_custom_target(RcppPackage ALL 
      COMMAND find ${CMAKE_SOURCE_DIR} -name "*.o" -exec rm "{}" "\;" 
      COMMAND find ${CMAKE_SOURCE_DIR} -name "*.so" -exec rm "{}" "\;" 
      COMMAND ${LIBR_EXECUTABLE} "--slave" "-e" "\"stopifnot(require(roxygen2));roxygenize('${CMAKE_SOURCE_DIR}',roclets=c('rd','collate','namespace'))\"" 
      COMMAND ${LIBR_EXECUTABLE} CMD INSTALL "${CMAKE_SOURCE_DIR}") 
  

• Настройка roxygenize и R CMD INSTALL в CMakeLists.txt

• Сформировать проект с CMake

  mkdir build # don't create subdirectory of RcppPackage 
  cd build 
  cmake -G "Eclipse CDT4 - Unix Makefiles" <path to RcppPackage> -DCMAKE_ECLIPSE_GENERATE_SOURCE_PROJECT=TRUE 
  

• Открыть затмение и импорт проектов из build (См cmake-eclipse-cdt, например). После индексирования пользуйтесь несколькими удобными функциями, предоставляемыми Eclipse CDT , такими как трассировка и автозаполнение.

• Вы можете создать проект, который будет преобразован в R CMD INSTALL или что-нибудь в CMakeLists.txt.