Попробуйте изменить подмодуль, как описано в git bookмерзавец гт -r не работает в подмодуль
$ git rm -r vendor/html-minifier
$ git submodule add https://github.com/kangax/html-minifier.git vendor/html-minifier
Но он не со следующими
rm 'vendor/html-minifier'
fatal: git rm: 'vendor/html-minifier': Is a directory
try git rm -rf vendor/html-minifier –
Не помогло. То же, что и 'git rm -r vendor/html-minifier' – stereobooster