Добавить заголовок в строку, используя AWK

Question

У меня есть файл в следующем формате:

AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
CCGTAGATCCGAACTTGTG 
CGTAGATCCGAACTTGT 

Я хочу дать заголовок каждой строки, используя AWK, где заголовок равно в следующей строке, как это:

>AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
>ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
>CCGTAGATCCGAACTTGTG 
CCGTAGATCCGAACTTGTG 
>CGTAGATCCGAACTTGT 
CGTAGATCCGAACTTGT 

Answer 1

Флаг -v позволяет вам установить переменную. Затем для каждой строки в файле напечатайте эту переменную, за которой следует строка, а затем сама строка.

awk -v c=">" '{ print c $0; print $0; }' <file> 

Answer 2

Просто:

$ awk '{print ">"$0;print}' file 
>AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
>ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
>CCGTAGATCCGAACTTGTG 
CCGTAGATCCGAACTTGTG 
>CGTAGATCCGAACTTGT 
CGTAGATCCGAACTTGT 

Или:

$ awk '{printf ">%s\n%s\n",$0,$0}' file 
>AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
AACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
>ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
ACCCGTAGATCCGAACTTGTG 
>CCGTAGATCCGAACTTGTG 
CCGTAGATCCGAACTTGTG 
>CGTAGATCCGAACTTGT 
CGTAGATCCGAACTTGT