Вы можете использовать несвязанный rdiff
extension (см. answer to an earlier question), чтобы увидеть текстовую разницу.
Ни один из инструментов визуального разграничения, о которых я знаю (Beyond Compare, kdiff3, meld, DiffMerge) работает по сети. Однако, если ваши репозитории находятся в одной и той же локальной сети, было бы нелегко написать небольшое расширение, чтобы найти расходящиеся файлы между двумя наборами изменений в двух репозиториях, добавить их в каталог temp и запустить визуальный diff там, что в основном что ExtDiff делает в пределах одного репо.
Niall C's answer по-прежнему является предпочтительным выбором, так как вам рано или поздно нужно вытащить мастер-репо (чем раньше, тем лучше), так что вы можете просто просто потянуть и разбить локально.
Этот вопрос кажется более подходящим для http://programmers.stackexchange.com –