R-пакет deSolve: Ошибка в checkFunc

Question

Я довольно новичок в R, и я пытаюсь решить систему дифференциальных уравнений с пакетом deSolve.

У меня есть 10000 временных меток и каждые 100 timesteps, я должен изменить значения переменных. Код я попытался дает мне следующую ошибку:

Error in checkFunc(Func2, times, y, rho) : 
    The number of derivatives returned by func() (2) must equal the length of the initial conditions vector (3) 

Я не совсем уверен, где ошибка приходит. Вот мой код до сих пор:

library(deSolve) 

#--------variables and parameter-------------------------- 


parameters <- c(up = 0.0001, hm = 0.1, hp = 0,889, mm = 0.1 , nt = 100) 
yini <- c(u = 1, m = 0.001, h = 0.001) 
times <- seq(0,100, by=0.1) 
out<- NULL 

#--------functions--------------------------------------- 
DiffU <- function(t, yini, parameters){ 
    with(as.list(c(yini, parameters)),{ 

    #functions 
    du <- -(up*u) + hm*h + (1/2*nt)*h 
    dm <- hp*h - mm*m - (1/nt)*m 

    # return functions 
    list(c(du, dm)) 
    }) 
} 

#--------------------------------------------- 
repeat{ 
    out<- rbind(out, ode(yini, times, DiffU, parameters)) 
    yini<-c(u = u+0.5*h, m = 0.001, h = m+0.5*h) 
    x<- x+1 
    if (x==100){ 
    break 
    } 
} 

У вас есть какие-либо предложения, чтобы избавиться от ошибки или улучшить код? Большое спасибо!

Answer 1

Ваша проблема в том, что у вас есть две производные «du» и «dm», но три значения для yini («u», «m» и «h»). Это вызывает ошибку.

Одно из решений: (1) добавить третью производную или (2) удалить «h» из yini и добавить ее к параметрам.