Мне действительно нужно grep всей строки. У меня есть файл с кучей строк, которые выглядят как этотКак grep шаблон, за которым следует число, только если число превышает определенное значение
1 123213 A T . stuff=1.232;otherstuf=34;morestuff=121;AF=0.44;laststuff=AV
4 223152 D L . stuff=1.122;otherstuf=4;morestuff=41;AF=0.02;laststuff=RV
, и я хочу, чтобы все строки, где AF> 0,1. Поэтому для строк выше я хочу только сохранить первую строку.
Вы можете использовать awk с несколькими разделителями для извлечения значения и сравнить его:
$ awk -F';|=' '$8 > 0.1' file
Предполагая, что AF всегда в форме 0.NN вы можете просто совпадают со значениями, где десятки место 1-9, например:
grep ';AF=0.[1-9][0-9];' your_file.csv
Вы можете добавить + после второй группы символов для поддержки дополнительных цифр (т.е. 0.NNNNN), но если значения могут быть вне диапазона [0, 1), вы не должны пытаться сопоставить это поле с регулярными выражениями.
Использование гну-AWK вы можете сделать это:
awk 'gensub(/.*;AF=([^;]+).*/, "\\1", "1", $NF)+0 > 0.1' file
1 123213 A T . stuff=1.232;otherstuf=34;morestuff=121;AF=0.44;laststuff=AV
Эта gensub функция разбирает из AF=<number> из последнего поля ввода и фиксирует число в захваченной группы № 1, который используется для сравнения с 0.1.
PS: +0 преобразует разобранное поле в число.
Это должно быть принято, фактически +1 –
@AkshayHegde с использованием функции подстановки, то есть 'gensub' означает, что это медленнее, чем другие решения. – Zlemini
Медленнее/быстрее не проблема. В соответствии с требованием OP должно соответствовать условию 'AF> 0,1', которое может быть или не быть в заданной позиции. – anubhava
Я бы использовал awk. Поскольку awk поддерживает буквенно-цифровые сравнения вы можете просто использовать это:
awk -F';' '$(NF-1) > "AF=0.1"' file.txt
-F';' разбивает строку на поля по ;. $(NF-1) адресует второе последнее поле в строке. (NF этого число полей)
$ awk -F= '$5>0.1' file
1 123213 A T . stuff=1.232;otherstuf=34;morestuff=121;AF=0.44;laststuff=AV
Если это не делать то, что вы хотите при запуске вместо ваших реальных данных, затем отредактируйте свой вопрос, чтобы предоставить более по-настоящему представительный образец ввода/вывода.
Знаете ли вы, что 'AF' всегда имеет форму' 0.NN'? Если нет, вы должны разобрать поля и сравнить значение как число, а не пытаться использовать регулярные выражения. – dimo414
Нет, это не последовательное количество цифр. Может быть AF = 1 или AF = 0,00054435. Я надеялся избежать его раскалывания, но хорошо. Спасибо за помощь!! –
Нет ничего плохого в извлечении поля (и оно даже не обязательно будет менее эффективным), и гораздо правильнее делать арифметику, чем сопоставление строк. – dimo414