Вот таблица, в которой я пытаюсь манипулировать:Вычислить значение в столбце для каждой строки
colnames sampA sampB
#1 conA conB
#2 1.1 4.4
#3 2.2 5.5
#4 3.3 6.6
Я хочу, чтобы вычислить log2 (х (1-х)) для каждого номера в $ sampB. Вот мой код до сих пор:
DF[-1,3] <- apply(DF[-1,]$sampB,1,function(x) log2(x(1-x)))
тогда я получил сообщение об ошибке:
dim(X) must have a positive length
Вы не должны apply() как log2() является векторизация. Попробуйте
x <- as.numeric(as.character(DF$sampB[-1]))
log2(x * (1 - x))
Я снял первый элемент, потому что я не совсем уверен, что это conB часть о (и теперь вы подтвердили это в комментариях). Я также подозреваю, что столбец может быть фактором (из-за conB), поэтому я обернул столбец в as.numeric(as.character(...)). Это может быть необязательно, но лучше безопасно, чем жаль.
Пришел в том случае, когда я импортировал его так, что 'as.numeric (as.character (...)), вероятно, необходимо. – CCurtis
Вы совершенно правы. –
Каков результат использования 'sapply (DF, class)'? –
Привет, @RichardScriven Я попробовал функцию без log2(), как только x + 1, она показала ту же самую ошибку msg. и conA и conB - это просто текст в исходных данных. Мне не нужны они для расчета, но мне они могут понадобиться позже. –
Хорошо, тогда я думаю, что мой ответ ниже будет работать. Он удаляет первый элемент –